RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 CLPSP04118 112 aa5.94□□□□□ -1.46
CCL20-202ENST00000409189 IGKV3-11P04433 115 aa5.94□□□□□ -1.46
CCL20-202ENST00000409189 IFNA16P05015 189 aa5.94□□□□□ -1.46
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CCL20-202ENST00000409189 FPR3P25089 353 aa5.94□□□□□ -1.46
CCL20-202ENST00000409189 ELK4P28324 431 aa5.94□□□□□ -1.46
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CCL20-202ENST00000409189 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
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CCL20-202ENST00000409189 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
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CCL20-202ENST00000409189 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa5.94□□□□□ -1.46
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CCL20-202ENST00000409189 A0A0B4J2E0 115 aa5.93□□□□□ -1.46
CCL20-202ENST00000409189 A0A1B0GX12 115 aa5.93□□□□□ -1.46
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CCL20-202ENST00000409189 TO15178 435 aa5.93□□□□□ -1.46
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CCL20-202ENST00000409189 CT45A8P0DMV1 189 aa5.93□□□□□ -1.46
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CCL20-202ENST00000409189 CHMP24386 653 aa5.93□□□□□ -1.46
CCL20-202ENST00000409189 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CCL20-202ENST00000409189 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
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CCL20-202ENST00000409189 OR1D4P47884 311 aa5.93□□□□□ -1.46
CCL20-202ENST00000409189 IDH2P48735 452 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CCL20-202ENST00000409189 PGDP52209 483 aa5.93□□□□□ -1.46
CCL20-202ENST00000409189 ZNF136P52737 540 aa5.93□□□□□ -1.46
CCL20-202ENST00000409189 CRISP1P54107 249 aa5.93□□□□□ -1.46
CCL20-202ENST00000409189 SLC37A1P57057 533 aa5.93□□□□□ -1.46
CCL20-202ENST00000409189 KRTAP10-11P60412 298 aa5.93□□□□□ -1.46
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