RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 SLC22A23A1A5C7 686 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 OR5H15A6NDH6 313 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 OR5H14A6NHG9 310 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 OR5H1A6NKK0 313 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 OR7A17O14581 309 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 CD79AP11912 226 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 ICAM2P13598 275 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 IL3RAP26951 378 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 TPMTP51580 245 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 HNF4GQ14541 408 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF542PQ5EBM4 170 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 OR1J2Q8NGS2 313 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 SLC6A17Q9H1V8 727 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 STEAP1Q9UHE8 339 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 LTBP4Q8N2S1 1624 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 SULT2B1O00204 365 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 ADAM10O14672 748 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 CD53P19397 219 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 AOAHP28039 575 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 UBE2G2P60604 165 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 LTBQ06643 244 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 RAB35Q15286 201 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 ENTPD8Q5MY95 495 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 HBMQ6B0K9 141 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 OR6V1Q8N148 313 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 C15orf54Q8N8G6 183 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 OR8J2Q8NGG1 315 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 OR4D6Q8NGJ1 314 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 MUCL1Q96DR8 90 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 CRB3Q9BUF7 120 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 GSX2Q9BZM3 304 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 A0A0B4J2A0 478 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 ADAM12O43184 909 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 SULT1B1O43704 296 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 CSO75390 466 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 EMP2P54851 167 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 DEFB110Q30KQ9 67 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 C5orf46Q6UWT4 87 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF480Q8WV37 535 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 LINC01599Q8WXQ3 324 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 GHSRQ92847 366 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 CDS1Q92903 461 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 SLCO4A1Q96BD0 722 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 GPR174Q9BXC1 333 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 SHPKQ9UHJ6 478 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 ADAM23O75077 832 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 SCO1O75880 301 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 SYN1P17600 705 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 DCAF7P61962 342 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 SLC9A3R2Q15599 337 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 GLB1L2Q8IW92 636 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 DEFB119Q8N690 84 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 ACOT4Q8N9L9 421 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 LGALS14Q8TCE9 139 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 ASB11Q8WXH4 323 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 PSMF1Q92530 271 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 SLC19A3Q9BZV2 496 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 INIPQ9NRY2 104 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 OR52A4PA6NMU1 304 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 KCNK2O95069 426 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 NPBWR1P48145 328 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 TM4SF4P48230 202 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 RAB11AP62491 216 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 HHEXQ03014 270 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 SFXN4Q6P4A7 337 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 SLC38A5Q8WUX1 472 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 UCN3Q969E3 161 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 FGGYQ96C11 551 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 PSD2Q9BQI7 771 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 SEC22CQ9BRL7 303 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 NUDT9Q9BW91 350 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 ADAM19Q9H013 955 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 SLC38A1Q9H2H9 487 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 A3GALT2U3KPV4 340 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 LRP5LA4QPB2 252 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 GABARAPH6UMI1 98 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF195O14628 629 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 PTGER4P35408 488 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 VIPR2P41587 438 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 MAGEB1P43366 347 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 UBE2KP61086 200 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 CHRNEQ04844 493 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 C3orf38Q5JPI3 329 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 OPN5Q6U736 354 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa8.24□□□□□ -1.09
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