RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368226.8

PTPRK-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRK, Length 6,087 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-207ENST00000368226 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 GRPP07492 148 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 CD79BP40259 229 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 CLDN6P56747 220 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 SLC36A2Q495M3 483 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 SLC46A1Q96NT5 459 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 SEMA4GQ9NTN9 838 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 TMEM45AQ9NWC5 275 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 ANKRD12Q6UB98 2062 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 CTNSO60931 367 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 BDKRB2P30411 391 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 HOXA9P31269 272 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 LUMP51884 338 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 FAM219BQ5XKK7 198 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 ZNF679Q8IYX0 411 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 CHTF18Q8WVB6 975 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 OR5B12Q96R08 314 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 METTL9Q9H1A3 318 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 IGHEP01854 428 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 DUSP5Q16690 384 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 LHX8Q68G74 356 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 MFSD12Q6NUT3 480 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 FNDC9Q8TBE3 224 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 P2RY12Q9H244 342 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 OBP2AQ9NY56 170 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 KCND3Q9UK17 655 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 RCE1Q9Y256 329 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 ASB1Q9Y576 335 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 NRAPQ86VF7 1730 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 SFRP5Q5T4F7 317 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 DEDD2Q8WXF8 326 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 TSLPQ969D9 159 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 PPT2Q9UMR5 302 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 ALPLP05186 524 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 ST6GAL1P15907 406 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 KIAA1024LP59773 190 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 FOXK2Q01167 660 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 APOOLQ6UXV4 268 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 SNAPC3Q92966 411 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 SELENOIQ9C0D9 397 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 IL37Q9NZH6 218 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 C7orf72A4D263 438 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 SSTR2P30874 369 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 METAP1P53582 386 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 HCCSP53701 268 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 EDDM3BP56851 147 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 PGM2L1Q6PCE3 622 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 COMMD7Q86VX2 200 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 TMEM178AQ8NBL3 297 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 C22orf15Q8WYQ4 148 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 NICN1Q9BSH3 213 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 LANCL2Q9NS86 450 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 WDR37Q9Y2I8 494 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 TMEM11P17152 192 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 EPHA5P54756 1037 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 MUL1Q969V5 352 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 MS4A6EQ96DS6 147 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 NOX3Q9HBY0 568 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 ZNF587BE7ETH6 402 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 CTDSP2O14595 271 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 GFERP55789 205 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 SLC14A1Q13336 389 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 LSAMPQ13449 338 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 EDDM3AQ14507 147 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 ZNF674Q2M3X9 581 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 AFMIDQ63HM1 303 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 DMBX1Q8NFW5 382 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 ASB17Q8WXJ9 295 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 SERTAD4Q9NUC0 356 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 A0A087WUU8 490 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 PTHP01270 115 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 LPLP06858 475 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 SHC1P29353 583 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 FAM198BQ6UWH4 519 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 TMEM174Q8WUU8 243 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 SLC23A2Q9UGH3 650 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 EFSO43281 561 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 B4GALT3O60512 393 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 GLSO94925 669 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
PTPRK-207ENST00000368226 MFAP5Q13361 173 aa11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.9 ms