RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 C5orf46Q6UWT4 87 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 SSX8Q7RTT4 187 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 GPAT4Q86UL3 456 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 COMTD1Q86VU5 262 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 P2RY8Q86VZ1 359 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 CALHM3Q86XJ0 350 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 PTOV1Q86YD1 416 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 TREML1Q86YW5 311 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 PGAM4Q8N0Y7 254 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM99Q8N816 258 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF611Q8N823 705 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 KBTBD8Q8NFY9 601 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 ELOA3Q8NG57 546 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 OR9K2Q8NGE7 335 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM171Q8WVE6 324 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 IGFBPL1Q8WX77 278 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 PROX1Q92786 737 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 FBXW5Q969U6 566 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM45BQ96B21 275 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 NSL1Q96IY1 281 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 CXorf56Q9H5V9 222 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 C12orf10Q9HB07 376 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 PARPBPQ9NWS1 579 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 TAS2R16Q9NYV7 291 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 NPAP1Q9NZP6 1156 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 ABCD2Q9UBJ2 740 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 USF3Q68DE3 2245 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1B0GWA3 101 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 DPRXA6NFQ7 191 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 FTCDNL1E5RQL4 147 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 RNF223E7ERA6 249 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 PDLIM1O00151 329 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 TPST1O60507 370 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 ATP5HO75947 161 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 VAMP5O95183 116 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 STAMBPO95630 424 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 ITGA5P08648 1049 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 PNMTP11086 282 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 HTR2AP28223 471 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 RPS5P46782 204 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 PTH2RP49190 550 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 P2RY4P51582 365 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 CDH11P55287 796 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 LIPEQ05469 1076 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 SELPLGQ14242 412 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 GABRA6Q16445 453 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 TSPO2Q5TGU0 170 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 C9orf135Q5VTT2 229 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 OR7E24Q6IFN5 339 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 C6orf89Q6UWU4 347 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 AAED1Q7RTV5 226 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 MICU2Q8IYU8 434 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 FITM2Q8N6M3 262 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 LSMEM1Q8N8F7 131 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 ZIC4Q8N9L1 334 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 OR52E4Q8NGH9 312 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 OR52N5Q8NH56 324 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 STK35Q8TDR2 534 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 NEUROG1Q92886 237 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF583Q96ND8 569 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 PTDSS2Q9BVG9 487 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 GSX2Q9BZM3 304 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 MUC13Q9H3R2 512 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 PIF1Q9H611 641 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM27Q9HBJ8 222 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 SLC7A10Q9NS82 523 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 ADA2Q9NZK5 511 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 UPB1Q9UBR1 384 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 RPS6KA6Q9UK32 745 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 LAMP3Q9UQV4 416 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1W2PR80 420 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 M0QX08 132 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 ABCD4O14678 606 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 TMCC2O75069 709 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 KRT33AO76009 404 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 MFN2O95140 757 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-201ENST00000361543 LGI1O95970 557 aa6.73□□□□□ -1.33
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