RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 DPEP2Q9H4A9 486 aa15.38■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 MCIDASD6RGH6 385 aa15.37■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 SLC25A12O75746 678 aa15.37■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 PAPLNO95428 1278 aa15.37■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 HMGN3Q15651 99 aa15.37■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa15.37■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 PLSCR5A0PG75 271 aa15.37■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 PQLC2LA1A4F0 135 aa15.37■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 DCTN6O00399 190 aa15.37■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 ADAM10O14672 748 aa15.37■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 IFNA2P01563 188 aa15.37■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 BDH1Q02338 343 aa15.37■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 AMZ1Q400G9 498 aa15.37■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 APCDD1Q8J025 514 aa15.37■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 C16orf58Q96GQ5 468 aa15.37■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 AKR1E2Q96JD6 320 aa15.37■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 GDF15Q99988 308 aa15.37■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa15.37■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 MAFFQ9ULX9 164 aa15.37■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 WIF1Q9Y5W5 379 aa15.37■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 C1orf226A1L170 272 aa15.37■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 FZD6O60353 706 aa15.37■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 NR2C1P13056 603 aa15.37■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 F3P13726 295 aa15.37■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 C19orf48Q6RUI8 117 aa15.37■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 RD3Q7Z3Z2 195 aa15.37■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 TERB2Q8NHR7 220 aa15.37■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 ZNF563Q8TA94 476 aa15.37■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 ZNF417Q8TAU3 575 aa15.37■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 ISOC2Q96AB3 205 aa15.37■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 PRRT1Q99946 306 aa15.37■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 OPA3Q9H6K4 179 aa15.37■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 A0A0A6YYH2 397 aa15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 A6NJ64 397 aa15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 OR4E1P0C645 316 aa15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 C6P13671 934 aa15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 CHATP28329 748 aa15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 SERPINF1P36955 418 aa15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 SLC9A3R2Q15599 337 aa15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 LCTLQ6UWM7 567 aa15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 OVCH1Q7RTY7 1134 aa15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 UBAC2Q8NBM4 344 aa15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 PCBD2Q9H0N5 130 aa15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 NTNG1Q9Y2I2 539 aa15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 CSAG2Q9Y5P2 127 aa15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 IFITM5A6NNB3 132 aa15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 ZNF878C9JN71 531 aa15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 FFAR1O14842 300 aa15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 SURF4O15260 269 aa15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 STC2O76061 302 aa15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 CD3DP04234 171 aa15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 SFTA3P0C7M3 94 aa15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 GAAP10253 952 aa15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 CPN1P15169 458 aa15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 MC3RP41968 323 aa15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 FOXK2Q01167 660 aa15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 KLHL24Q6TFL4 600 aa15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 FAM24BQ8N5W8 94 aa15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 GPR32P1Q8NGA4 272 aa15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 EDEM2Q9BV94 578 aa15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 DHDHQ9UQ10 334 aa15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 MPTX1A8MV57 137 aa15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 NUDT19A8MXV4 375 aa15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 RECKO95980 971 aa15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 F2P00734 622 aa15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 OR8G3PP0DMU2 310 aa15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 IMPA1P29218 277 aa15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 SLC6A12P48065 614 aa15.36■□□□□ 0.05
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PACS1-201ENST00000320580 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 CDK5Q00535 292 aa15.36■□□□□ 0.05
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PACS1-201ENST00000320580 SOHLH1Q5JUK2 328 aa15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 ZNF280BQ86YH2 543 aa15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 SLAMF9Q96A28 289 aa15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 CENPMQ9NSP4 180 aa15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 GRXCR1A8MXD5 290 aa15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 WASH3PC4AMC7 463 aa15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 RNF224P0DH78 156 aa15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 OR13C7P0DN81 318 aa15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 FUT10Q6P4F1 479 aa15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 C17orf99Q6UX52 265 aa15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 GPR148Q8TDV2 347 aa15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 TAAR2Q9P1P5 351 aa15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 KLHL42Q9P2K6 505 aa15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 HMGN4O00479 90 aa15.35■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 TCAPO15273 167 aa15.35■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 P2RX6O15547 441 aa15.35■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 HOXB5P09067 269 aa15.35■□□□□ 0.05
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