RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299705.9

TMED3-201, Transcript of transmembrane p24 trafficking protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMED3, Length 1,475 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED3-201ENST00000299705 FHL1Q13642 323 aa16.06■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 POU4F3Q15319 338 aa16.06■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 MS4A18Q3C1V0 323 aa16.06■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 ZBED5Q49AG3 693 aa16.06■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 OR2A2Q6IF42 318 aa16.06■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 PPP4R4Q6NUP7 873 aa16.06■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 PLXDC2Q6UX71 529 aa16.06■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 C3P1Q6ZMU1 363 aa16.06■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa16.06■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 STK32CQ86UX6 486 aa16.06■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 SDCCAG3Q96C92 435 aa16.06■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 ZFP3Q96NJ6 502 aa16.06■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 DMRTA2Q96SC8 542 aa16.06■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 TAS2R5Q9NYW4 299 aa16.06■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 KLHL9Q9P2J3 617 aa16.06■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 SIGLEC7Q9Y286 467 aa16.06■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa16.05■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 A0A1B0GUH1 482 aa16.05■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 A0A1W2PNV4 684 aa16.05■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 ZNF716A6NP11 495 aa16.05■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa16.05■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 RAMP1O60894 148 aa16.05■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 RCBTB2O95199 551 aa16.05■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 OR6A2O95222 327 aa16.05■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 GLI4P10075 376 aa16.05■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 PUDPQ08623 228 aa16.05■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa16.05■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 SLC17A1Q14916 467 aa16.05■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 TAF11Q15544 211 aa16.05■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 FAHD1Q6P587 224 aa16.05■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 RPRMLQ8N4K4 120 aa16.05■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 ATG16L2Q8NAA4 619 aa16.05■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 C9orf106Q8NAJ2 232 aa16.05■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 OR13C2Q8NGS9 318 aa16.05■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 DNAJC9Q8WXX5 260 aa16.05■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 OXGR1Q96P68 337 aa16.05■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa16.05■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 ZNF556Q9HAH1 456 aa16.05■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 BCO1Q9HAY6 547 aa16.05■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa16.05■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 POLEQ07864 2286 aa16.05■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa16.04■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 SAC3D1A6NKF1 404 aa16.04■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 TOXO94900 526 aa16.04■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 IL2RAP01589 272 aa16.04■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 ADORA3P0DMS8 318 aa16.04■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 POU2F1P14859 743 aa16.04■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 UQCRFS1P47985 274 aa16.04■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 PRPS1P60891 318 aa16.04■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa16.04■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa16.04■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 PXKQ7Z7A4 578 aa16.04■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 EPHX4Q8IUS5 362 aa16.04■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 MCEMP1Q8IX19 187 aa16.04■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 OR51A7Q8NH64 312 aa16.04■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 ABHD3Q8WU67 409 aa16.04■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa16.04■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 C9orf16Q9BUW7 83 aa16.04■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa16.04■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 B3GAT1Q9P2W7 334 aa16.04■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 TRAV27A0A087WT01 109 aa16.03■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 ZNF724A8MTY0 619 aa16.03■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 CCL21O00585 134 aa16.03■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 GPR171O14626 319 aa16.03■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 CRHP06850 196 aa16.03■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 AHCYP23526 432 aa16.03■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 DAPP51397 102 aa16.03■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 PMPCAQ10713 525 aa16.03■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 GUSBP1Q15486 140 aa16.03■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 GPAT4Q86UL3 456 aa16.03■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 MARVELD2Q8N4S9 558 aa16.03■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 CLDN22Q8N7P3 220 aa16.03■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 PRR7Q8TB68 274 aa16.03■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 CIB1Q99828 191 aa16.03■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 UCK2Q9BZX2 261 aa16.03■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 MCCC2Q9HCC0 563 aa16.03■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 EMC3Q9P0I2 261 aa16.03■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 KLHL13Q9P2N7 655 aa16.03■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 NOX1Q9Y5S8 564 aa16.03■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 RNF13O43567 381 aa16.03■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 NDUFB2O95178 105 aa16.03■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 HPRP00739 348 aa16.03■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 YES1P07947 543 aa16.03■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 ZNF43P17038 809 aa16.03■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 AQP2P41181 271 aa16.03■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 PPP2R2BQ00005 443 aa16.03■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 C4orf17Q53FE4 359 aa16.03■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 ALG10Q5BKT4 473 aa16.03■□□□□ 0.16
TMED3-201ENST00000299705 KDM4DQ6B0I6 523 aa16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.7 ms