RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299162.9

FOXN4-201, Transcript of forkhead box N4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN4, Length 3,350 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN4-201ENST00000299162 APOC3P02656 99 aa9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 HMGN1P05114 100 aa9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 CD3GP09693 182 aa9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 CPEP16870 476 aa9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 DNASE1P24855 282 aa9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 SHC1P29353 583 aa9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 GAS1P54826 345 aa9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 ZP2Q05996 745 aa9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 FTMTQ8N4E7 242 aa9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 POGLUT1Q8NBL1 392 aa9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 OR2T35Q8NGX2 323 aa9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 KLHL15Q96M94 604 aa9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 OR10A5Q9H207 317 aa9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 ENAMQ9NRM1 1142 aa9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 ANKRD61A6NGH8 418 aa9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 SLC35E2P0CK97 266 aa9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 STOMP27105 288 aa9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 ELOCQ15369 112 aa9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 Q3ZCU0 254 aa9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 PLK5Q496M5 336 aa9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 LRFN4Q6PJG9 635 aa9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 CD300LDQ6UXZ3 194 aa9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 SSX6Q7RTT6 188 aa9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 CLDN22Q8N7P3 220 aa9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 SAMD12Q8N8I0 201 aa9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 C17orf47Q8NEP4 570 aa9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 ZNF563Q8TA94 476 aa9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 LINC00052Q96N35 136 aa9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 NIPAL2Q9H841 368 aa9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 KNTC1P50748 2209 aa9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 FAM186AA6NE01 2351 aa9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 IDSB3KWA1 339 aa9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 MCIDASD6RGH6 385 aa9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 OIP5O43482 229 aa9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 DHFRP00374 187 aa9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 CD1CP29017 333 aa9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 NIPAL3Q6P499 406 aa9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 ALKAL2Q6UX46 152 aa9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 MED25Q71SY5 747 aa9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 IZUMO1Q8IYV9 350 aa9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 ZPLD1Q8TCW7 415 aa9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 TEAD3Q99594 435 aa9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 PDE7BQ9NP56 450 aa9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 SDHAF3Q9NRP4 125 aa9.26□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 F8W036 122 aa9.25□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 RCBTB2O95199 551 aa9.25□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 PLGP00747 810 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 HLA-DMAP28067 261 aa9.25□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 HTR1FP30939 366 aa9.25□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 ZNF273Q14593 569 aa9.25□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 NTRK2Q16620 822 aa9.25□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 FAM69BQ5VUD6 431 aa9.25□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 AP3S1Q92572 193 aa9.25□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 SGK3Q96BR1 496 aa9.25□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 SLC25A36Q96CQ1 311 aa9.25□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 UBQLN2Q9UHD9 624 aa9.25□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 SIGLEC7Q9Y286 467 aa9.25□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 CPED1A4D0V7 1026 aa9.25□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 C11orf98E9PRG8 122 aa9.25□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 M0R233 179 aa9.25□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 IL9P15248 144 aa9.25□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 ZNF3P17036 446 aa9.25□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 BCKDHBP21953 392 aa9.25□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 GIFP27352 417 aa9.25□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 PI4KAP42356 2102 aa9.25□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 CAPZBP47756 277 aa9.25□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 TSPAN5P62079 268 aa9.25□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 DEFA5Q01523 94 aa9.25□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 GPR176Q14439 515 aa9.25□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa9.25□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa9.25□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa9.25□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 CEACAM19Q7Z692 300 aa9.25□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 BCORP1Q8N888 145 aa9.25□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 OR5J2Q8NH18 312 aa9.25□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 SMPDL3BQ92485 455 aa9.25□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 DPYSL5Q9BPU6 564 aa9.25□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 PPA2Q9H2U2 334 aa9.25□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 GNG8Q9UK08 70 aa9.25□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
FOXN4-201ENST00000299162 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms