RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 C10orf53Q8N6V4 93 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 B3GAT1Q9P2W7 334 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 SEC14L4Q9UDX3 406 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 TMCC3Q9ULS5 477 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 PLPP3O14495 311 aa11.78□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 GPR171O14626 319 aa11.78□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 KLF4O43474 513 aa11.78□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 TIPRLO75663 272 aa11.78□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 YES1P07947 543 aa11.78□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 FCGR1AP12314 374 aa11.78□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 MAKP20794 623 aa11.78□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 SLC9A3P48764 834 aa11.78□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 ZP4Q12836 540 aa11.78□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 ANKDD1AQ495B1 522 aa11.78□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM201Q5SNT2 666 aa11.78□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM225Q6GV28 225 aa11.78□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 XKRXQ6PP77 449 aa11.78□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 MRGPRGQ86SM5 289 aa11.78□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 TUSC5Q8IXB3 177 aa11.78□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 CDK20Q8IZL9 346 aa11.78□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 LRRC17Q8N6Y2 441 aa11.78□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 OR9K2Q8NGE7 335 aa11.78□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 OR6K3Q8NGY3 331 aa11.78□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 SDCCAG3Q96C92 435 aa11.78□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 OXGR1Q96P68 337 aa11.78□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 EMC3Q9P0I2 261 aa11.78□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 CLEC4AQ9UMR7 237 aa11.78□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 HIF3AQ9Y2N7 669 aa11.78□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 EMC9Q9Y3B6 208 aa11.78□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa11.78□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 HCFC1P51610 2035 aa11.78□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 LRRK2Q5S007 2527 aa11.78□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 ARRDC5A6NEK1 342 aa11.77□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 EFCAB9A8MZ26 197 aa11.77□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 MS4A18H0YCH9 400 aa11.77□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 GNGT2O14610 69 aa11.77□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 CDC42EP2O14613 210 aa11.77□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 DVL2O14641 736 aa11.77□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 CLOCKO15516 846 aa11.77□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 OR10H3O60404 316 aa11.77□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 UQCRC1P31930 480 aa11.77□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 IFNGR2P38484 337 aa11.77□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 PUDPQ08623 228 aa11.77□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 PMS2P3Q13401 168 aa11.77□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 ATP6AP1Q15904 470 aa11.77□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 MICAQ29983 383 aa11.77□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 MS4A18Q3C1V0 323 aa11.77□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 C1orf94Q6P1W5 598 aa11.77□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 VWA1Q6PCB0 445 aa11.77□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa11.77□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 ZER1Q7Z7L7 766 aa11.77□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 LIX1LQ8IVB5 337 aa11.77□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 LILRB4Q8NHJ6 448 aa11.77□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 PYDC1Q8WXC3 89 aa11.77□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM45BQ96B21 275 aa11.77□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 STARD4Q96DR4 205 aa11.77□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 PIGMQ9H3S5 423 aa11.77□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 NTN4Q9HB63 628 aa11.77□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 TAS2R5Q9NYW4 299 aa11.77□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 U3KQV3 271 aa11.77□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 ANKRD65E5RJM6 399 aa11.76□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 H3BNX3 289 aa11.76□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 ENTPD5O75356 428 aa11.76□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 CCNB2O95067 398 aa11.76□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 HPRP00739 348 aa11.76□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 CGAP01215 116 aa11.76□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 HIST1H2ABP04908 130 aa11.76□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 RNF224P0DH78 156 aa11.76□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 ADORA3P0DMS8 318 aa11.76□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 SAGP10523 405 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 CD8BP10966 210 aa11.76□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 BMP5P22003 454 aa11.76□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 FPR3P25089 353 aa11.76□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 FASP25445 335 aa11.76□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 GPR4P46093 362 aa11.76□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 IST1P53990 364 aa11.76□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 SIRPAP78324 504 aa11.76□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 FHL1Q13642 323 aa11.76□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa11.76□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 PGBD2Q6P3X8 592 aa11.76□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 NHLRC1Q6VVB1 395 aa11.76□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 CREB3L2Q70SY1 520 aa11.76□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa11.76□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 PXKQ7Z7A4 578 aa11.76□□□□□ -0.53
CCDC42-201ENST00000293845 GALNT5Q7Z7M9 940 aa11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.8 ms