RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000280245.8

CCDC83-201, Transcript of coiled-coil domain containing 83, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene CCDC83, Length 2,358 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83-201ENST00000280245 IL20RBQ6UXL0 311 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 JAZF1Q86VZ6 243 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 EXD3Q8N9H8 876 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 SMIM19Q96E16 107 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 NCDNQ9UBB6 729 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 OGG1O15527 345 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 APEHP13798 732 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 THBS2P35442 1172 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 PSMB10P40306 273 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 GDI2P50395 445 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 TPTEP56180 551 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 SIRPAP78324 504 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 ACY1Q03154 408 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 TRAM1Q15629 374 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 MESTQ5EB52 335 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 HBMQ6B0K9 141 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 OR2I1PQ8NGU4 316 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 TXNDC15Q96J42 360 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 TSPAN32Q96QS1 320 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 C12orf10Q9HB07 376 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 A0A0G2JK05 382 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 SCRG1O75711 98 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 ANKRD34CP0C6C1 535 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP14.91□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 SELENBP1Q13228 472 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 IL10RAQ13651 578 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 OR5M10Q6IEU7 315 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 RABEPKQ7Z6M1 372 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 SYT9Q86SS6 491 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 C7orf57Q8NEG2 295 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 DUSP19Q8WTR2 217 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 THAP4Q8WY91 577 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 PIGKQ92643 395 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 APMAPQ9HDC9 416 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 GRHPRQ9UBQ7 328 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 B4DXG7 233 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 SEC14L5O43304 696 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 ELK1P19419 428 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 PGCP20142 388 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 SQSTM1Q13501 440 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 IL18Q14116 193 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 SFXN4Q6P4A7 337 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 ANKRD37Q7Z713 158 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 UBE2J2Q8N2K1 259 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 Q8N402 240 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 MS4A15Q8N5U1 240 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 FKRPQ9H9S5 495 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 TAS2R5Q9NYW4 299 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 RASD1Q9Y272 281 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 C2orf72A6NCS6 295 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 C19orf67A6NJJ6 358 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 PLA2G10O15496 165 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 GDF9O60383 454 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 TXNDC12O95881 172 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 BGLAPP02818 100 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 CAPZA2P47755 286 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 P2RX1P51575 399 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 CBFBQ13951 182 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 QPRTQ15274 297 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 MZT2AQ6P582 158 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 OR4D9Q8NGE8 314 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 CEP76Q8TAP6 659 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 ITPKCQ96DU7 683 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 PTDSS2Q9BVG9 487 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 SEMA4CQ9C0C4 833 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC83-201ENST00000280245 OR6C70A6NIJ9 312 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC83-201ENST00000280245 PAHP00439 452 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC83-201ENST00000280245 HEXBP07686 556 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC83-201ENST00000280245 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CCDC83-201ENST00000280245 MYL9P24844 172 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC83-201ENST00000280245 HOXA6P31267 233 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC83-201ENST00000280245 ASAH1Q13510 395 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC83-201ENST00000280245 MAMSTRQ6ZN01 415 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC83-201ENST00000280245 NUP54Q7Z3B4 507 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC83-201ENST00000280245 OR6V1Q8N148 313 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC83-201ENST00000280245 EID2Q8N6I1 236 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC83-201ENST00000280245 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CCDC83-201ENST00000280245 SLC25A36Q96CQ1 311 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC83-201ENST00000280245 CCDC74BQ96LY2 380 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms