RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 SLC5A10A0PJK1 596 aa20.14■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 OR2F2O95006 317 aa20.14■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 EPXP11678 715 aa20.14■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 C6P13671 934 aa20.14■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 OR2F1Q13607 317 aa20.14■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 COX20Q5RI15 118 aa20.14■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 PARGQ86W56 976 aa20.14■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 NRSN1Q8IZ57 195 aa20.14■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 RNF175Q8N4F7 328 aa20.14■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 DNAAF1Q8NEP3 725 aa20.14■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 RSRP1Q9BUV0 290 aa20.14■□□□□ 0.82
PITX1-201ENST00000265340 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa20.14■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 FAM86C2PA6NEL3 165 aa20.14■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa20.14■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 GJA4P35212 333 aa20.14■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 NRG3P56975 720 aa20.14■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 NKAPLQ5M9Q1 402 aa20.14■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa20.14■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 C6orf120Q7Z4R8 191 aa20.14■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 EBPLQ9BY08 206 aa20.14■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 TGIF2Q9GZN2 237 aa20.14■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 ZNF749O43361 778 aa20.13■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 HOXB5P09067 269 aa20.13■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 VSIG10L2P0DP72 767 aa20.13■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 HOXA5P20719 270 aa20.13■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 CDK6Q00534 326 aa20.13■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 NDUFA9Q16795 377 aa20.13■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 ANXA8L1Q5VT79 327 aa20.13■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 TMEM244Q5VVB8 128 aa20.13■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 CDPF1Q6NVV7 123 aa20.13■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 TMEM159Q96B96 161 aa20.13■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 MALSU1Q96EH3 234 aa20.13■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 NRIP2Q9BQI9 281 aa20.13■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 CHST5Q9GZS9 411 aa20.13■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 MBTPS2O43462 519 aa20.13■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 C6orf47O95873 294 aa20.13■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 IGHA1P01876 353 aa20.13■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 CD79AP11912 226 aa20.13■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 RNH1P13489 461 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 EDN3P14138 238 aa20.13■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 PAX1P15863 534 aa20.13■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 CD81P60033 236 aa20.13■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 PDGFRLQ15198 375 aa20.13■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 NCMAPQ5T1S8 102 aa20.13■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 LIPJQ5W064 366 aa20.13■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 NPSR1Q6W5P4 371 aa20.13■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 YAF2Q8IY57 180 aa20.13■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 OR4A4PQ8NGN8 299 aa20.13■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 MIEF1Q9NQG6 463 aa20.13■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 WASF3Q9UPY6 502 aa20.13■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 C2CD4DB7Z1M9 353 aa20.12■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 GABARAPH6UMI1 98 aa20.12■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 ASGR2P07307 311 aa20.12■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 CD22P20273 847 aa20.12■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 GDI1P31150 447 aa20.12■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 TFF2Q03403 129 aa20.12■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 RUNX3Q13761 415 aa20.12■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 CSRP2Q16527 193 aa20.12■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 GGTA1PQ4G0N0 100 aa20.12■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 IL34Q6ZMJ4 242 aa20.12■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 ANGPTL5Q86XS5 388 aa20.12■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 CACUL1Q86Y37 369 aa20.12■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 OR52N2Q8NGI0 321 aa20.12■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 HLA-CQ95604 372 aa20.12■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 NUS1Q96E22 293 aa20.12■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 OR2AG1Q9H205 316 aa20.12■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 MMP26Q9NRE1 261 aa20.12■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 TSTD3H0UI37 97 aa20.12■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 EMC8O43402 210 aa20.12■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 ATP1B1P05026 303 aa20.12■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 H1F0P07305 194 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 FZD5Q13467 585 aa20.12■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 TDGQ13569 410 aa20.12■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 MAPK14Q16539 360 aa20.12■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa20.12■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 PRR18Q8N4B5 295 aa20.12■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 HMGB4Q8WW32 186 aa20.12■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 TUBA4BQ9H853 241 aa20.12■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 PRSS16Q9NQE7 514 aa20.12■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 PRDM6Q9NQX0 595 aa20.12■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa20.11■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 NPC1O15118 1278 aa20.11■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 EPHX1P07099 455 aa20.11■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 S100A2P29034 98 aa20.11■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 CRABP1P29762 137 aa20.11■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 AVPR2P30518 371 aa20.11■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 F2RL1P55085 397 aa20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms