RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262124.15

SEH1L-201, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEH1L, Length 3,494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-201ENST00000262124 CCDC182A6NF36 153 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-201ENST00000262124 MPZL1O95297 269 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-201ENST00000262124 HLA-DOBP13765 273 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-201ENST00000262124 SRP9P49458 86 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-201ENST00000262124 TMED10P49755 219 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-201ENST00000262124 SKP2Q13309 424 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-201ENST00000262124 FHL1Q13642 323 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-201ENST00000262124 GALEQ14376 348 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-201ENST00000262124 QPRTQ15274 297 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-201ENST00000262124 OGFOD3Q6PK18 319 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-201ENST00000262124 GPAT4Q86UL3 456 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-201ENST00000262124 YIPF7Q8N8F6 280 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-201ENST00000262124 CCDC74BQ96LY2 380 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-201ENST00000262124 RNF32Q9H0A6 362 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-201ENST00000262124 NLKQ9UBE8 527 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-201ENST00000262124 EPHA6Q9UF33 1036 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-201ENST00000262124 CEP192Q8TEP8 1941 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-201ENST00000262124 IRGMA1A4Y4 181 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-201ENST00000262124 PRR32B1ATL7 298 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-201ENST00000262124 NPIPB9F8W1W9 429 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-201ENST00000262124 TAF4O00268 1085 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-201ENST00000262124 LAMTOR5O43504 91 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-201ENST00000262124 PRKCAP17252 672 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-201ENST00000262124 ELK1P19419 428 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-201ENST00000262124 SFTPDP35247 375 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-201ENST00000262124 GDI2P50395 445 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-201ENST00000262124 OR2B6P58173 313 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-201ENST00000262124 PAMR1Q6UXH9 720 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-201ENST00000262124 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-201ENST00000262124 PRSS45Q7RTY3 260 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-201ENST00000262124 MDGA2Q7Z553 956 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-201ENST00000262124 PELI1Q96FA3 418 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-201ENST00000262124 MSANTD3Q96H12 275 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-201ENST00000262124 RARRES3Q9UL19 164 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-201ENST00000262124 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-201ENST00000262124 BOLA1Q9Y3E2 137 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-201ENST00000262124 ZNF337Q9Y3M9 751 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-201ENST00000262124 SAGE2PA6NJ88 616 aa11.08□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 OR7A10O76100 309 aa11.08□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 IL1AP01583 271 aa11.08□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 NUDT1P36639 197 aa11.08□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 EMP2P54851 167 aa11.08□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 MRGPREQ86SM8 312 aa11.08□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 D2HGDHQ8N465 521 aa11.08□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 LSMEM1Q8N8F7 131 aa11.08□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 NPEPL1Q8NDH3 523 aa11.08□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa11.08□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 DERL3Q96Q80 235 aa11.08□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 MMP25Q9NPA2 562 aa11.08□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 CHRNA9Q9UGM1 479 aa11.08□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 CCNKO75909 580 aa11.08□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 CSF3P09919 207 aa11.08□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 GP1BBP13224 206 aa11.08□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 ZNF28P17035 718 aa11.08□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 MYL9P24844 172 aa11.08□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 ZNF74Q16587 644 aa11.08□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 ZNF181Q2M3W8 571 aa11.08□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 COL28A1Q2UY09 1125 aa11.08□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 BTBD16Q32M84 506 aa11.08□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 OR5H6Q8NGV6 325 aa11.08□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 ENKURQ8TC29 256 aa11.08□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 ADIPOR1Q96A54 375 aa11.08□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 C5orf34Q96MH7 638 aa11.08□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 MED29Q9NX70 200 aa11.08□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa11.08□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 CUL9Q8IWT3 2517 aa11.08□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 ANKRD33BA6NCL7 494 aa11.08□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 EFCAB7A8K855 629 aa11.08□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 XKRYO14609 159 aa11.08□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 SLC16A7O60669 478 aa11.08□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 OR2J2O76002 312 aa11.08□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 IL33O95760 270 aa11.08□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 IGHA1P01876 353 aa11.08□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 MAS1P04201 325 aa11.08□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 SPARCP09486 303 aa11.08□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 RNF4P78317 190 aa11.08□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 C19orf57Q0VDD7 668 aa11.08□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 OR7A5Q15622 319 aa11.08□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 CARD17Q5XLA6 110 aa11.08□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 LRRN1Q6UXK5 716 aa11.08□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 DNASE2BQ8WZ79 361 aa11.08□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 NSMAFQ92636 917 aa11.08□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 EDAQ92838 391 aa11.08□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 MR1Q95460 341 aa11.08□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 ENAMQ9NRM1 1142 aa11.08□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 MED17Q9NVC6 651 aa11.08□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa11.07□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 SUSD5O60279 629 aa11.07□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 CD3GP09693 182 aa11.07□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 LIMK1P53667 647 aa11.07□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 CD83Q01151 205 aa11.07□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 SLC25A30Q5SVS4 291 aa11.07□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 TUBA3EQ6PEY2 450 aa11.07□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 OR6V1Q8N148 313 aa11.07□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 ZNF485Q8NCK3 441 aa11.07□□□□□ -0.64
SEH1L-201ENST00000262124 OR1N1Q8NGS0 311 aa11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms