RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261443.9

CSDE1-201, Transcript of cold shock domain containing E1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CSDE1, Length 3,228 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1-201ENST00000261443 GPR62Q9BZJ7 368 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 FKRPQ9H9S5 495 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 PPIL1Q9Y3C6 166 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa6.64□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 A0A0G2JN53 185 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 GGT3PA6NGU5 568 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 GLOD5A6NK44 160 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 CLN5O75503 358 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 RCBTB2O95199 551 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 PAPLNO95428 1278 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 APEHP13798 732 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 SLC2A5P22732 501 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 NTSP30990 170 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 HSD17B2P37059 387 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 TAS2R38P59533 333 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 POU4F2Q12837 409 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 GFOD2Q3B7J2 385 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 TMEM220Q6QAJ8 160 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 THSD4Q6ZMP0 1018 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 MAMSTRQ6ZN01 415 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 STX12Q86Y82 276 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 OR4A4PQ8NGN8 299 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 PFN4Q8NHR9 129 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 PHYHIPQ92561 330 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 TIFAQ96CG3 184 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 MMP26Q9NRE1 261 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 DZANK1Q9NVP4 752 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 DMRT1Q9Y5R6 373 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 C2orf74A8MZ97 194 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 MAN2B1O00754 1011 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 NARSO43776 548 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 RDH16O75452 317 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 CD3DP04234 171 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 CD79AP11912 226 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF3P17036 446 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 ACTR1AP61163 376 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 CXADRP78310 365 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 GUCA2AQ02747 115 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 CCL15Q16663 113 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 CDNFQ49AH0 187 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 PARGQ86W56 976 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 NUDT13Q86X67 352 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 SYS1Q8N2H4 156 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 SDR9C7Q8NEX9 313 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 OR5M8Q8NGP6 311 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 OR10R2Q8NGX6 335 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 CD99L2Q8TCZ2 262 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 SLC2A12Q8TD20 617 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 RNF141Q8WVD5 230 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 OR7D2Q96RA2 312 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 CLCC1Q96S66 551 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 TRPV4Q9HBA0 871 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 SDHAF3Q9NRP4 125 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 C20orf141Q9NUB4 165 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 UFSP2Q9NUQ7 469 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 DCAF16Q9NXF7 216 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 UPB1Q9UBR1 384 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 FAM96BQ9Y3D0 163 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 GXYLT2A0PJZ3 443 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 CCSO14618 274 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 KIAA0355O15063 1070 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 GREM1O60565 184 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 PPP1R3DO95685 299 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 LY86O95711 162 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 NQO2P16083 231 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 CERS1P27544 350 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 PRLHRP49683 370 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 ATP1B3P54709 279 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 OR7A5Q15622 319 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 DEFB115Q30KQ5 88 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 KLHL26Q53HC5 615 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 NKAPLQ5M9Q1 402 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 DNM1P46Q6ZS02 220 aa6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.3 ms