RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253122.9

SLC6A8-201, Transcript of solute carrier family 6 member 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC6A8, Length 3,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A8-201ENST00000253122 BVESQ8NE79 360 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 OR14C36Q8NHC7 312 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 ULBP3Q9BZM4 244 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 NCDNQ9UBB6 729 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 TUBAL3A6NHL2 446 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 FAM157BP0CG42 384 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 ADH5P11766 374 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 P2RX1P51575 399 aa14.63□□□□□ -0.07
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SLC6A8-201ENST00000253122 RIN1Q13671 783 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 ENPP2Q13822 863 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 FAM76BQ5HYJ3 339 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 SLC48A1Q6P1K1 146 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 ABHD17CQ6PCB6 329 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 TAF8Q7Z7C8 310 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 PTP4A1Q93096 173 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 PELI1Q96FA3 418 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 PEX11GQ96HA9 241 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 GSKIPQ9P0R6 139 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 ADAM29Q9UKF5 820 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 INSL6Q9Y581 213 aa14.63□□□□□ -0.07
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SLC6A8-201ENST00000253122 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 DCDC2BA2VCK2 349 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 TBC1D3LB9A6J9 549 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 CSF1P09603 554 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 TBC1D3HP0C7X1 549 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 RORAP35398 523 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 TDGQ13569 410 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 MFSD12Q6NUT3 480 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 TMEM106AQ96A25 262 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 GMEB2Q9UKD1 530 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 PPIL1Q9Y3C6 166 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.073e-6■■■□□ 15.9
SLC6A8-201ENST00000253122 UBBP0CG47 229 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 ARHGAP19Q14CB8 494 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 ARMC6Q6NXE6 501 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 OR7G2Q8NG99 324 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 MARC2Q969Z3 335 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 SLC25A36Q96CQ1 311 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 TMEM231Q9H6L2 316 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 LDAHQ9H6V9 325 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 IL21Q9HBE4 155 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa14.62□□□□□ -0.07
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SLC6A8-201ENST00000253122 UBA52P62987 128 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 SHC2P98077 582 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 TMEM150AQ86TG1 271 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 LNX2Q8N448 690 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 OR11G2Q8NGC1 345 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 OR51Q1Q8NH59 317 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 PTDSS2Q9BVG9 487 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 GPR34Q9UPC5 381 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 TMEM82A0PJX8 343 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 GPRIN2O60269 458 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 GABRA1P14867 456 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 NAGAP17050 411 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 BTCP35070 178 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 ZP1P60852 638 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 GUCA2AQ02747 115 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 OTPQ5XKR4 325 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 TMEM64Q6YI46 380 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 SSX6Q7RTT6 188 aa14.62□□□□□ -0.07
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SLC6A8-201ENST00000253122 CRIPAKQ8N1N5 446 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 VN1R3Q9BXE9 311 aa14.62□□□□□ -0.07
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SLC6A8-201ENST00000253122 EGFP01133 1207 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 GALP22466 123 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 VITQ6UXI7 678 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 RAB11FIP2Q7L804 512 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 ASPGQ86U10 573 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 ADIPOR2Q86V24 386 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 OR4C16Q8NGL9 310 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 HRH4Q9H3N8 390 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 SLC6A5Q9Y345 797 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 A0A1B0GWA3 101 aa14.61□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 C11orf98E9PRG8 122 aa14.61□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 H7C1C5 153 aa14.61□□□□□ -0.07
SLC6A8-201ENST00000253122 PAPLNO95428 1278 aa14.61□□□□□ -0.07
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