RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225576.7

TVP23C-201, Transcript of trans-golgi network vesicle protein 23 homolog C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TVP23C, Length 1,527 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23C-201ENST00000225576 MYL12BO14950 172 aa15.15■□□□□ 0.02
TVP23C-201ENST00000225576 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
TVP23C-201ENST00000225576 CBR3O75828 277 aa15.15■□□□□ 0.02
TVP23C-201ENST00000225576 APOL3O95236 402 aa15.15■□□□□ 0.02
TVP23C-201ENST00000225576 ATE1O95260 518 aa15.15■□□□□ 0.02
TVP23C-201ENST00000225576 F13BP05160 661 aa15.15■□□□□ 0.02
TVP23C-201ENST00000225576 CD36P16671 472 aa15.15■□□□□ 0.02
TVP23C-201ENST00000225576 DPP4P27487 766 aa15.15■□□□□ 0.02
TVP23C-201ENST00000225576 ATP6V1E1P36543 226 aa15.15■□□□□ 0.02
TVP23C-201ENST00000225576 TGFBR2P37173 567 aa15.15■□□□□ 0.02
TVP23C-201ENST00000225576 CLK1P49759 484 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
TVP23C-201ENST00000225576 LGALS3BPQ08380 585 aa15.15■□□□□ 0.02
TVP23C-201ENST00000225576 C1DQ13901 141 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
TVP23C-201ENST00000225576 TGIF1Q15583 401 aa15.15■□□□□ 0.02
TVP23C-201ENST00000225576 ABHD17BQ5VST6 288 aa15.15■□□□□ 0.02
TVP23C-201ENST00000225576 SLC6A19Q695T7 634 aa15.15■□□□□ 0.02
TVP23C-201ENST00000225576 C3orf33Q6P1S2 294 aa15.15■□□□□ 0.02
TVP23C-201ENST00000225576 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
TVP23C-201ENST00000225576 OR4F15Q8NGB8 312 aa15.15■□□□□ 0.02
TVP23C-201ENST00000225576 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
TVP23C-201ENST00000225576 RASD2Q96D21 266 aa15.15■□□□□ 0.02
TVP23C-201ENST00000225576 ARL5BQ96KC2 179 aa15.15■□□□□ 0.02
TVP23C-201ENST00000225576 Q96M85 177 aa15.15■□□□□ 0.02
TVP23C-201ENST00000225576 NMNAT3Q96T66 252 aa15.15■□□□□ 0.02
TVP23C-201ENST00000225576 INIPQ9NRY2 104 aa15.15■□□□□ 0.02
TVP23C-201ENST00000225576 ABI3Q9P2A4 366 aa15.15■□□□□ 0.02
TVP23C-201ENST00000225576 GRHPRQ9UBQ7 328 aa15.15■□□□□ 0.02
TVP23C-201ENST00000225576 PCNX3Q9H6A9 2034 aa15.14■□□□□ 0.02
TVP23C-201ENST00000225576 DMXL1Q9Y485 3027 aa15.14■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa15.14■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 SHISA8B8ZZ34 492 aa15.14■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 OR6A2O95222 327 aa15.14■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 TFPIP10646 304 aa15.14■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 CLUP10909 449 aa15.14■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 IL11P20809 199 aa15.14■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 ITGA3P26006 1051 aa15.14■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 PCSK6P29122 969 aa15.14■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 IDUAP35475 653 aa15.14■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 RPS7P62081 194 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 ZP4Q12836 540 aa15.14■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 POU4F2Q12837 409 aa15.14■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 SELENBP1Q13228 472 aa15.14■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 CTF1Q16619 201 aa15.14■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 SLC35D3Q5M8T2 416 aa15.14■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 PAQR6Q6TCH4 344 aa15.14■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 JAZF1Q86VZ6 243 aa15.14■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF227Q86WZ6 799 aa15.14■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 CLEC1AQ8NC01 280 aa15.14■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 OR51G2Q8NGK0 314 aa15.14■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF417Q8TAU3 575 aa15.14■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 GNRHR2Q96P88 292 aa15.14■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 ANKRD10Q9NXR5 420 aa15.14■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa15.13■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 OR6C68A6NDL8 312 aa15.13■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 LIPT2A6NK58 231 aa15.13■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 RNF13O43567 381 aa15.13■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 SCG5P05408 212 aa15.13■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 LIMS3P0CW19 117 aa15.13■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 LIMS4P0CW20 117 aa15.13■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 HSMCR30P0CW71 290 aa15.13■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 IMPDH2P12268 514 aa15.13■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 RGS6P49758 472 aa15.13■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 SLC25A1P53007 311 aa15.13■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 WNT4P56705 351 aa15.13■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 LCN1P1Q5VSP4 162 aa15.13■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 B3GLCTQ6Y288 498 aa15.13■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 SHFQ7M4L6 423 aa15.13■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 ACBD7Q8N6N7 88 aa15.13■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa15.13■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 DNAJA3Q96EY1 480 aa15.13■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 TSPAN32Q96QS1 320 aa15.13■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF649Q9BS31 505 aa15.13■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 ISYNA1Q9NPH2 558 aa15.13■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa15.13■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 INPP5EQ9NRR6 644 aa15.13■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 ALKBH4Q9NXW9 302 aa15.13■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 SEC14L4Q9UDX3 406 aa15.13■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 G3V3Y1 287 aa15.12■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 ZIC3O60481 467 aa15.12■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 IGHMP01871 453 aa15.12■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 SBK2P0C263 348 aa15.12■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 CNR1P21554 472 aa15.12■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 CD96P40200 585 aa15.12■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 CASRP41180 1078 aa15.12■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 DIO1P49895 249 aa15.12■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 SLC16A1P53985 500 aa15.12■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 RTP5Q14D33 572 aa15.12■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 PON3Q15166 354 aa15.12■□□□□ 0.01
TVP23C-201ENST00000225576 OR7A5Q15622 319 aa15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.4 ms