RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639284.1

CRBN-215, Transcript of cereblon, human

TSL 5 BASIC

Gene CRBN, Length 2,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRBN-215	ENST00000639284	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	SCN2A	Q99250	2005 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	C5orf42	Q9H799	3197 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	PRSS38	A1L453	326 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	URAD	A6NGE7	173 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	TRIM77	I1YAP6	450 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	IMPA2	O14732	288 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	ZFPL1	O95159	310 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	CBX7	O95931	251 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	ALDOB	P05062	364 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	IL5	P05113	134 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	ACSM4	P0C7M7	580 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	FCAR	P24071	287 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	LBX1	P52954	281 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	LINC00303	Q3SY05	128 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	ZNF626	Q68DY1	528 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	ABHD13	Q7L211	337 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	HAVCR1	Q96D42	359 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	SFXN2	Q96NB2	322 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	SRMS	Q9H3Y6	488 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	NOX3	Q9HBY0	568 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	MED9	Q9NWA0	146 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	OR6C68	A6NDL8	312 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	IDS	B3KWA1	339 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	ARPC3	O15145	178 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	SPI1	P17947	270 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	MAGEB1	P43366	347 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	RAP2B	P61225	183 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	PSG6	Q00889	435 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	LGALS3BP	Q08380	585 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	CSRP2	Q16527	193 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	ISX	Q2M1V0	245 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	SLC25A25	Q6KCM7	469 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	PIGK	Q92643	395 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	FGF13	Q92913	245 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	MRI1	Q9BV20	369 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	CHIA	Q9BZP6	476 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	IL23A	Q9NPF7	189 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284		V9GY05	133 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284		A0A087WV48	116 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	NDUFB6	O95139	128 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	IGKV1D-16	P01601	117 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	CALCB	P10092	127 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	DCTD	P32321	178 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	CLDN12	P56749	244 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	IL10RA	Q13651	578 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	ULK3	Q6PHR2	472 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	FIGLA	Q6QHK4	219 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	DGAT2L6	Q6ZPD8	337 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	CAMKV	Q8NCB2	501 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	OR5T3	Q8NGG3	340 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	SYNPR	Q8TBG9	265 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	NSMAF	Q92636	917 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	KLHL15	Q96M94	604 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	NMNAT3	Q96T66	252 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	RDH8	Q9NYR8	311 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	SCML1	Q9UN30	329 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	EML5	Q05BV3	1969 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284		A6NCN8	305 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	FOXS1	O43638	330 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	SNAPC5	O75971	98 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	TPPP	O94811	219 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	C4BPB	P20851	252 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	S1PR1	P21453	382 aa		11.62	□□□□□ -0.55

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