RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, human

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGEF1-209	ENST00000607882	C6orf47	O95873	294 aa		11.39	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	TPO	P07202	933 aa		11.39	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	SPN	P16150	400 aa		11.39	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	UGT2B10	P36537	528 aa		11.39	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	MAP4K2	Q12851	820 aa		11.39	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	TP53BP2	Q13625	1128 aa		11.39	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	NDUFA5	Q16718	116 aa		11.39	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		11.39	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		11.39	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	RTL4	Q6ZR62	310 aa		11.39	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		11.39	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		11.39	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		11.39	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		11.39	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	SP140L	Q9H930	580 aa		11.39	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		11.39	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		11.39	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		11.39	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	BTNL2	Q9UIR0	455 aa		11.39	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	CACNA1C	Q13936	2221 aa		11.39	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	RAB19	A4D1S5	217 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	NPIPA8	P0DM63	369 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	SOAT1	P35610	550 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	MVD	P53602	400 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	TRA2B	P62995	288 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	LACC1	Q8IV20	430 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	NFKBID	Q8NI38	313 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	ELP4	Q96EB1	424 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	EXO5	Q9H790	373 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	BRD7	Q9NPI1	651 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	ISPD	A4D126	451 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	SULT1B1	O43704	296 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	ABO	P16442	354 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	PSG6	Q00889	435 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	FOXO1	Q12778	655 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	IFI44L	Q53G44	452 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZAR1	Q86SH2	424 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	VSTM2L	Q96N03	204 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	COL21A1	Q96P44	957 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	PELO	Q9BRX2	385 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	FBN2	P35556	2912 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882		B4DXG7	233 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	CCL21	O00585	134 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	GABRA3	P34903	492 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	RGS6	P49758	472 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	SCARB2	Q14108	478 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	SIAH3	Q8IW03	269 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	TAGAP	Q8N103	731 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	OR5D16	Q8NGK9	328 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	OR5M1	Q8NGP8	315 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	RADIL	Q96JH8	1075 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	ARL5B	Q96KC2	179 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	KCNE3	Q9Y6H6	103 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	ADRA2A	P08913	450 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	FBXO45	P0C2W1	286 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	ANXA8	P13928	327 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	GABRB1	P18505	474 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	SOX6	P35712	828 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	PCYT1A	P49585	367 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	PRIM2	P49643	509 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	NRG3	P56975	720 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	MED22	Q15528	200 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	MICA	Q29983	383 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RABGEF1-209	ENST00000607882	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		11.37	□□□□□ -0.59

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