RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BRD7Q9NPI1 651 aa10.77□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GMEB2Q9UKD1 530 aa10.77□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NOX1Q9Y5S8 564 aa10.77□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OGG1O15527 345 aa10.76□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 VWA2Q5GFL6 755 aa10.76□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRSS45Q7RTY3 260 aa10.76□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NOXA1Q86UR1 476 aa10.76□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TPRA1Q86W33 373 aa10.76□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM151BQ8IW70 566 aa10.76□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR14A16Q8NHC5 309 aa10.76□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRIM63Q969Q1 353 aa10.76□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RFT1Q96AA3 541 aa10.76□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DERL3Q96Q80 235 aa10.76□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC25A18Q9H1K4 315 aa10.76□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NANSQ9NR45 359 aa10.76□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UBQLN4Q9NRR5 601 aa10.76□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LANCL2Q9NS86 450 aa10.76□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MCUBQ9NWR8 336 aa10.76□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRAV6A0A075B6T7 132 aa10.76□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A1W2PR77 199 aa10.76□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa10.76□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR2B3O76000 313 aa10.76□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UTS2O95399 124 aa10.76□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ADRB1P08588 477 aa10.76□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EPXP11678 715 aa10.76□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CLDN20P56880 219 aa10.76□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR1D5P58170 312 aa10.76□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP10.76□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CDONQ4KMG0 1287 aa10.76□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C1QL3Q5VWW1 255 aa10.76□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GKN2Q86XP6 184 aa10.76□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CMIPQ8IY22 773 aa10.76□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF285Q96NJ3 590 aa10.76□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MARVELD1Q9BSK0 173 aa10.76□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ALG12Q9BV10 488 aa10.76□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A1B0GTH9 108 aa10.75□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TVP23AA6NH52 213 aa10.75□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM150CB9EJG8 249 aa10.75□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GPANK1O95872 356 aa10.75□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UBL4AP11441 157 aa10.75□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARSBP15848 533 aa10.75□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CD53P19397 219 aa10.75□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP10.75□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GRK6P43250 576 aa10.75□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CTXN1P60606 82 aa10.75□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DGCR2P98153 550 aa10.75□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZP2Q05996 745 aa10.75□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SKP2Q13309 424 aa10.75□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UBXN2BQ14CS0 331 aa10.75□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRAM1Q15629 374 aa10.75□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF74Q16587 644 aa10.75□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LINC01590Q5TEZ4 76 aa10.75□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 POMGNT2Q8NAT1 580 aa10.75□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CEP76Q8TAP6 659 aa10.75□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NOX4Q9NPH5 578 aa10.75□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CUTCQ9NTM9 273 aa10.75□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRODH2Q9UF12 536 aa10.75□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KLHL21Q9UJP4 597 aa10.75□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa10.75□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM72A0PK05 275 aa10.75□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TLCD2A6NGC4 264 aa10.75□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SCDO00767 359 aa10.75□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PIN1P1O15428 100 aa10.75□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ICOSLGO75144 302 aa10.75□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PPM1BO75688 479 aa10.75□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CD27P26842 260 aa10.75□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CLDN12P56749 244 aa10.75□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LGALS3BPQ08380 585 aa10.75□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FNDC7Q5VTL7 733 aa10.75□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 WBP2NLQ6ICG8 309 aa10.75□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF563Q8TA94 476 aa10.75□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LPAR4Q99677 370 aa10.75□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa10.75□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FOXQ1Q9C009 403 aa10.75□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FER1L5A0AVI2 2057 aa10.75□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 METTL12A8MUP2 240 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARPC3O15145 178 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FLRT2O43155 660 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF264O43296 627 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZFPL1O95159 310 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GUSBP08236 651 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRAPPC2P0DI81 140 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRAPPC2BP0DI82 140 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GLULP15104 373 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AHCYP23526 432 aa10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms