RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 TUBA1BP68363 451 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 TUBA4AP68366 448 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 IFFO1Q0D2I5 559 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 BNIP2Q12982 314 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 MAPK11Q15759 364 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 CHI3L2Q15782 390 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 COX20Q5RI15 118 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 NIPAL3Q6P499 406 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 TUBA1AQ71U36 451 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 PEX5LQ8IYB4 626 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 RFLNBQ8N5W9 214 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM169BQ8N8A8 192 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 NUP37Q8NFH4 326 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 OR4F15Q8NGB8 312 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 TEX37Q96LM6 180 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 PANX1Q96RD7 426 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 TAPBPLQ9BX59 468 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 LINC00470Q9BZP3 86 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 RAB1BQ9H0U4 201 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF442Q9H7R0 627 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 SEC61A2Q9H9S3 476 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 RLIMQ9NVW2 624 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 RAP2CQ9Y3L5 183 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A096LPE4 126 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A1W2PPZ6 126 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 WDR91A4D1P6 747 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 A8MVM7 634 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 hCG_2039718K7EN88 272 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 TCF21O43680 179 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 LILRA1O75019 489 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 NPIPB7O75200 414 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 UPK3AO75631 287 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 IL12AP29459 219 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 IL2RGP31785 369 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 RPL14P50914 215 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 CHN2P52757 468 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 UFM1P61960 85 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 HGFACQ04756 655 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 LIN52Q52LA3 116 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 C1orf140Q5VVS0 124 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 WBP2NLQ6ICG8 309 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 OGFOD2Q6N063 350 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF836Q6ZNA1 936 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF621Q6ZSS3 439 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 VRK2Q86Y07 508 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 EPHX4Q8IUS5 362 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 CADM2Q8N3J6 435 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 HPS1Q92902 700 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 C1orf159Q96HA4 380 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 SORT1Q99523 831 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 DOK1Q99704 481 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 NUF2Q9BZD4 464 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 MEAF6Q9HAF1 191 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 P2RX2Q9UBL9 471 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 HAO1Q9UJM8 370 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 RASD1Q9Y272 281 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 DSPPQ9NZW4 1301 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A096LPI6 279 aa8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM229AB2RXF0 380 aa8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 BIRC5O15392 142 aa8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 GSNP06396 782 aa8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 CELA3BP08861 270 aa8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 TFPTP0C1Z6 253 aa8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 DAOP14920 347 aa8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 CBR1P16152 277 aa8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 ITGA2P17301 1181 aa8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 APEX1P27695 318 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 THBS4P35443 961 aa8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC1A6P48664 564 aa8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 NME5P56597 212 aa8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 COPZ1P61923 177 aa8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 LRRC74AQ0VAA2 488 aa8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 KIRREL3Q8IZU9 778 aa8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF786Q8N393 782 aa8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 SVOPLQ8N434 492 aa8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 LINC01356Q8N9X3 169 aa8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 ANKK1Q8NFD2 765 aa8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 OR52P1PQ8NH57 321 aa8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 STK35Q8TDR2 534 aa8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 OR52E6Q96RD3 313 aa8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 SNX18Q96RF0 628 aa8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-226ENST00000593200 AIG1Q9NVV5 245 aa8.92□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms