RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580861.1

LINC00511-210, long intergenic non-protein coding RNA 511, humanhuman

TSL 4

Gene LINC00511, Length 467 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00511-210ENST00000580861 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa7.96□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 ZNF175Q9Y473 711 aa7.96□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa7.96□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 CACNA1CQ13936 2221 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 A0A1W2PNR3 127 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 CCDC160A6NGH7 325 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 TRIM64A6NGJ6 449 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 TRIM64CA6NLI5 447 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 GJE1A6NN92 205 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 FTCDNL1E5RQL4 147 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 SLC16A6O15403 523 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 AHCYL1O43865 530 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 NOL3O60936 208 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 AQP8O94778 261 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 IFNW1P05000 195 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 TFAP2AP05549 437 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 IMPDH2P12268 514 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 ANXA8P13928 327 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 KLK2P20151 261 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 P2RY4P51582 365 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 CASP6P55212 293 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 CDH12P55289 794 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 SMIM11AP58511 58 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 RAC3P60763 192 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 CSNK2BP67870 215 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 PMPCAQ10713 525 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 MYBPHQ13203 477 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 CDSNQ15517 529 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 HBMQ6B0K9 141 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 GPR141Q7Z602 305 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 SATL1Q86VE3 508 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 UBQLNLQ8IYU4 475 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 FAM26EQ8N5C1 309 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 MEIOBQ8N635 442 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 ATG16L2Q8NAA4 619 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 PIK3C3Q8NEB9 887 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 FNDC9Q8TBE3 224 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 STK35Q8TDR2 534 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 SMPDL3BQ92485 455 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 OSTF1Q92882 214 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 GRIP2Q9C0E4 1043 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 TMEM27Q9HBJ8 222 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 SERINC1Q9NRX5 453 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 KRT84Q9NSB2 600 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 ALKBH4Q9NXW9 302 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 PTTG2Q9NZH5 202 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 NDUFAF4Q9P032 175 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 SLC13A4Q9UKG4 626 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 TRAPPC4Q9Y296 219 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 A0A0G2JNJ9 132 aa7.94□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa7.94□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 TRAPPC13A5PLN9 417 aa7.94□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 ARRDC5A6NEK1 342 aa7.94□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 LIPT2A6NK58 231 aa7.94□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 A8MVM7 634 aa7.94□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 ZNF814B7Z6K7 855 aa7.94□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 J3KTA2 159 aa7.94□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 hCG_2039718K7EN88 272 aa7.94□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 CHP2O43745 196 aa7.94□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 CXCL13O43927 109 aa7.94□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 RCBTB2O95199 551 aa7.94□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 OR5F1O95221 314 aa7.94□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 PMS2P2O95744 297 aa7.94□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 GNAO1P09471 354 aa7.94□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 PNMTP11086 282 aa7.94□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 CCNA2P20248 432 aa7.94□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 ENPP1P22413 925 aa7.94□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 ALDH3B2P48448 385 aa7.94□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 DIO1P49895 249 aa7.94□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 CARD18P57730 90 aa7.94□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 VLDLRP98155 873 aa7.94□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 LTBQ06643 244 aa7.94□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 PON3Q15166 354 aa7.94□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP7.94□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 ALG10BQ5I7T1 473 aa7.94□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 ZNF691Q5VV52 312 aa7.94□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 KDM4DQ6B0I6 523 aa7.94□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 TMEM211Q6ICI0 200 aa7.94□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 ZNF773Q6PK81 442 aa7.94□□□□□ -1.14
LINC00511-210ENST00000580861 TBPL2Q6SJ96 375 aa7.94□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms