RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 EMCNQ9ULC0 261 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 FZD4Q9ULV1 537 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 NFU1Q9UMS0 254 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 FOXJ3Q9UPW0 622 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 BAIAP2Q9UQB8 552 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 RCE1Q9Y256 329 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
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PTPRM-204ENST00000577468 TTC37Q6PGP7 1564 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 CLASP1Q7Z460 1538 aa2.78□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 UGGT2Q9NYU1 1516 aa2.78□□□□□ -1.97
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PTPRM-204ENST00000577468 TMEM89A2RUT3 159 aa2.77□□□□□ -1.97
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PTPRM-204ENST00000577468 SCO1O75880 301 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 RGS11O94810 467 aa2.77□□□□□ -1.97
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PTPRM-204ENST00000577468 PMELP40967 661 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 AKR1C3P42330 323 aa2.77□□□□□ -1.97
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PTPRM-204ENST00000577468 KCNJ11Q14654 390 aa2.77□□□□□ -1.97
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PTPRM-204ENST00000577468 EIPR1Q53HC9 387 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 LRRC73Q5JTD7 316 aa2.77□□□□□ -1.97
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PTPRM-204ENST00000577468 SDHAF4Q5VUM1 108 aa2.77□□□□□ -1.97
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