RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa26.36■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 STMND1H3BQB6 276 aa26.36■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 WISP1O95388 367 aa26.36■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 TXNDC12O95881 172 aa26.36■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 SERPINA7P05543 415 aa26.36■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 GADD45AP24522 165 aa26.36■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC16A1P53985 500 aa26.36■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 LGALS3BPQ08380 585 aa26.36■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 SGCBQ16585 318 aa26.36■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 C1QL3Q5VWW1 255 aa26.36■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 H3F3CQ6NXT2 135 aa26.36■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 RAB43Q86YS6 212 aa26.36■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 SIRT6Q8N6T7 355 aa26.36■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR5J2Q8NH18 312 aa26.36■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 PTGES2Q9H7Z7 377 aa26.36■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 HPF1Q9NWY4 346 aa26.36■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa26.35■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 SDHAP31040 664 aa26.35■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 CLK1P49759 484 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 VBP1P61758 197 aa26.35■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM122BQ7Z309 247 aa26.35■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 FADS6Q8N9I5 356 aa26.35■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 NPEPL1Q8NDH3 523 aa26.35■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa26.35■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 PAQR8Q8TEZ7 354 aa26.35■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC25A36Q96CQ1 311 aa26.35■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 DDIT4LQ96D03 193 aa26.35■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 ANGPTL4Q9BY76 406 aa26.35■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 INPP5EQ9NRR6 644 aa26.35■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM86C1Q9NVL1 165 aa26.35■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 ERVK13-1Q9NX77 482 aa26.35■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 LSM3P62310 102 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 Q0VFX4 171 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 FOXF1Q12946 379 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 MFSD13AQ14CX5 517 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 PLPPR5Q32ZL2 321 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 LCN1P1Q5VSP4 162 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 GPR139Q6DWJ6 353 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 KLHL36Q8N4N3 616 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 ACBD7Q8N6N7 88 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR4K17Q8NGC6 315 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 DDOQ99489 341 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 ASPNQ9BXN1 380 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 SH2D2AQ9NP31 389 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 F8A1P23610 371 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC35D3Q5M8T2 416 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC22A10Q63ZE4 541 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 LHFPL3Q86UP9 236 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 JAZF1Q86VZ6 243 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR52N1Q8NH53 320 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 SGCZQ96LD1 299 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 Q96M85 177 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 LRFN3Q9BTN0 628 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 GRHPRQ9UBQ7 328 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 HRH3Q9Y5N1 445 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa26.33■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 CLUP10909 449 aa26.33■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 DOC2BQ14184 412 aa26.33■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 SSX1Q16384 188 aa26.33■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 ATCAYQ86WG3 371 aa26.33■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 WDSUB1Q8N9V3 476 aa26.33■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 RASD2Q96D21 266 aa26.33■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 NMNAT3Q96T66 252 aa26.33■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR11A1Q9GZK7 315 aa26.33■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 SERINC1Q9NRX5 453 aa26.33■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 TAS2R5Q9NYW4 299 aa26.33■■□□□ 1.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa26.32■■□□□ 1.8
CTDNEP1-208ENST00000573600 F13BP05160 661 aa26.32■■□□□ 1.8
CTDNEP1-208ENST00000573600 NCS1P62166 190 aa26.32■■□□□ 1.8
CTDNEP1-208ENST00000573600 IL10RAQ13651 578 aa26.32■■□□□ 1.8
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR2G6Q5TZ20 316 aa26.32■■□□□ 1.8
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRAMEF20Q5VT98 475 aa26.32■■□□□ 1.8
CTDNEP1-208ENST00000573600 B3GLCTQ6Y288 498 aa26.32■■□□□ 1.8
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMPRSS12Q86WS5 348 aa26.32■■□□□ 1.8
CTDNEP1-208ENST00000573600 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
CTDNEP1-208ENST00000573600 NTNG2Q96CW9 530 aa26.32■■□□□ 1.8
CTDNEP1-208ENST00000573600 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa26.32■■□□□ 1.8
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF649Q9BS31 505 aa26.32■■□□□ 1.8
CTDNEP1-208ENST00000573600 POTEKPQ9BYX7 375 aa26.32■■□□□ 1.8
CTDNEP1-208ENST00000573600 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa26.32■■□□□ 1.8
CTDNEP1-208ENST00000573600 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
CTDNEP1-208ENST00000573600 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa26.31■■□□□ 1.8
CTDNEP1-208ENST00000573600 MASP2O00187 686 aa26.31■■□□□ 1.8
CTDNEP1-208ENST00000573600 DXOO77932 396 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
CTDNEP1-208ENST00000573600 SBK2P0C263 348 aa26.31■■□□□ 1.8
CTDNEP1-208ENST00000573600 CD82P27701 267 aa26.31■■□□□ 1.8
CTDNEP1-208ENST00000573600 GRPRP30550 384 aa26.31■■□□□ 1.8
CTDNEP1-208ENST00000573600 PLCZ1Q86YW0 608 aa26.31■■□□□ 1.8
CTDNEP1-208ENST00000573600 MFSD8Q8NHS3 518 aa26.31■■□□□ 1.8
CTDNEP1-208ENST00000573600 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa26.31■■□□□ 1.8
CTDNEP1-208ENST00000573600 NPAS1Q99742 590 aa26.31■■□□□ 1.8
CTDNEP1-208ENST00000573600 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
CTDNEP1-208ENST00000573600 CORINQ9Y5Q5 1042 aa26.31■■□□□ 1.8
CTDNEP1-208ENST00000573600 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
CTDNEP1-208ENST00000573600 ANKRD33BA6NCL7 494 aa26.31■■□□□ 1.8
CTDNEP1-208ENST00000573600 C12orf71A8MTZ7 269 aa26.31■■□□□ 1.8
CTDNEP1-208ENST00000573600 FTCDNL1E5RQL4 147 aa26.31■■□□□ 1.8
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR6A2O95222 327 aa26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms