RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562298.1

VPS9D1-AS1-201, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VPS9D1-AS1, Length 931 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 C3orf49Q96BT1 292 aa14.54□□□□□ -0.08
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ZBTB18Q99592 522 aa14.54□□□□□ -0.08
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TAPBPLQ9BX59 468 aa14.54□□□□□ -0.08
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 NELFAQ9H3P2 528 aa14.54□□□□□ -0.08
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CA10Q9NS85 328 aa14.54□□□□□ -0.08
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa14.53□□□□□ -0.08
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TMEM229AB2RXF0 380 aa14.53□□□□□ -0.08
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 FTCDNL1E5RQL4 147 aa14.53□□□□□ -0.08
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ZNF587BE7ETH6 402 aa14.53□□□□□ -0.08
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 NR5A2O00482 541 aa14.53□□□□□ -0.08
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SNNO75324 88 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 UPK3AO75631 287 aa14.53□□□□□ -0.08
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 KRT33AO76009 404 aa14.53□□□□□ -0.08
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 IL6P05231 212 aa14.53□□□□□ -0.08
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 IGFBP5P24593 272 aa14.53□□□□□ -0.08
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 NR4A2P43354 598 aa14.53□□□□□ -0.08
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 WDR4P57081 412 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 DSTNP60981 165 aa14.53□□□□□ -0.08
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 COPZ1P61923 177 aa14.53□□□□□ -0.08
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TUBA1BP68363 451 aa14.53□□□□□ -0.08
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TUBA4AP68366 448 aa14.53□□□□□ -0.08
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 GGTLC2Q14390 218 aa14.53□□□□□ -0.08
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa14.53□□□□□ -0.08
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa14.53□□□□□ -0.08
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 NIPAL3Q6P499 406 aa14.53□□□□□ -0.08
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TUBA1AQ71U36 451 aa14.53□□□□□ -0.08
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ANKS4BQ8N8V4 417 aa14.53□□□□□ -0.08
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ANKRD42Q8N9B4 389 aa14.53□□□□□ -0.08
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 KATNB1Q9BVA0 655 aa14.53□□□□□ -0.08
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PRR14Q9BWN1 585 aa14.53□□□□□ -0.08
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PARD6BQ9BYG5 372 aa14.53□□□□□ -0.08
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SEC61A2Q9H9S3 476 aa14.53□□□□□ -0.08
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TPT1P8Q9HAU6 139 aa14.53□□□□□ -0.08
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CALML5Q9NZT1 146 aa14.53□□□□□ -0.08
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 LPAR3Q9UBY5 353 aa14.53□□□□□ -0.08
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PRDM4Q9UKN5 801 aa14.53□□□□□ -0.08
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 FKBP7Q9Y680 259 aa14.53□□□□□ -0.08
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 A0A096LPE4 126 aa14.52□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa14.52□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 A0A1W2PPZ6 126 aa14.52□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SLC35F4A4IF30 521 aa14.52□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TRPC5OSA6NMA1 111 aa14.52□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 NDUFS8O00217 210 aa14.52□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 LMX1BO60663 402 aa14.52□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SLC22A3O75751 556 aa14.52□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 VAMP5O95183 116 aa14.52□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CECR9P0C854 216 aa14.52□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ZCCHC18P0CG32 403 aa14.52□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 KITP10721 976 aa14.52□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 IDO1P14902 403 aa14.52□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SERPINF1P36955 418 aa14.52□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PDLIM4P50479 330 aa14.52□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 NAAAQ02083 359 aa14.52□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 EGR4Q05215 589 aa14.52□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ADIPOQQ15848 244 aa14.52□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa14.52□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 KDM8Q8N371 416 aa14.52□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TMEM19Q96HH6 336 aa14.52□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PIMREGQ9BSJ6 248 aa14.52□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PTDSS2Q9BVG9 487 aa14.52□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SHARPINQ9H0F6 387 aa14.52□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 THAP1Q9NVV9 213 aa14.52□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SEC14L4Q9UDX3 406 aa14.52□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 A0A096LPI6 279 aa14.51□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa14.51□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ANP32DO95626 131 aa14.51□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 IGLV1-44P01699 117 aa14.51□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CRYAAP02489 173 aa14.51□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PNMTP11086 282 aa14.51□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CALCRP30988 508 aa14.51□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 GZMKP49863 264 aa14.51□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 HOXC5Q00444 222 aa14.51□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa14.51□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 HHATQ5VTY9 493 aa14.51□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 NXNQ6DKJ4 435 aa14.51□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ANKRD16Q6P6B7 361 aa14.51□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 IL17RELQ6ZVW7 336 aa14.51□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 MAVSQ7Z434 540 aa14.51□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 OR9I1Q8NGQ6 314 aa14.51□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 STK35Q8TDR2 534 aa14.51□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 FOXN4Q96NZ1 517 aa14.51□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 KCNS3Q9BQ31 491 aa14.51□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SPATA9Q9BWV2 254 aa14.51□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 LINC00470Q9BZP3 86 aa14.51□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CHODLQ9H9P2 273 aa14.51□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 RASD1Q9Y272 281 aa14.51□□□□□ -0.09
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 A0A0G2JPF8 293 aa14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms