RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 PKP2Q99959 881 aa8.23□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 CHID1Q9BWS9 393 aa8.23□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 POTEKPQ9BYX7 375 aa8.23□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 OR51I1Q9H343 314 aa8.23□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 PIGUQ9H490 435 aa8.23□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 IL1RAPQ9NPH3 570 aa8.23□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 ADPRHL2Q9NX46 363 aa8.23□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 DSPPQ9NZW4 1301 aa8.23□□□□□ -1.09
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SMAD3-215ENST00000560424 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa8.22□□□□□ -1.09
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SMAD3-215ENST00000560424 TO15178 435 aa8.22□□□□□ -1.09
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SMAD3-215ENST00000560424 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
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SMAD3-215ENST00000560424 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa8.22□□□□□ -1.09
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SMAD3-215ENST00000560424 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
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SMAD3-215ENST00000560424 TMEM201Q5SNT2 666 aa8.22□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 PDSS1Q5T2R2 415 aa8.22□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
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SMAD3-215ENST00000560424 MED11Q9P086 117 aa8.22□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 METRNQ9UJH8 293 aa8.22□□□□□ -1.09
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SMAD3-215ENST00000560424 M0QX08 132 aa8.21□□□□□ -1.1
SMAD3-215ENST00000560424 SERPINB7O75635 380 aa8.21□□□□□ -1.1
SMAD3-215ENST00000560424 NKX2-2O95096 273 aa8.21□□□□□ -1.1
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SMAD3-215ENST00000560424 ERFP50548 548 aa8.21□□□□□ -1.1
SMAD3-215ENST00000560424 FABP6P51161 128 aa8.21□□□□□ -1.1
SMAD3-215ENST00000560424 EFNA4P52798 201 aa8.21□□□□□ -1.1
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SMAD3-215ENST00000560424 KCNJ10P78508 379 aa8.21□□□□□ -1.1
SMAD3-215ENST00000560424 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
SMAD3-215ENST00000560424 FUT5Q11128 374 aa8.21□□□□□ -1.1
SMAD3-215ENST00000560424 SCGB2A2Q13296 93 aa8.21□□□□□ -1.1
SMAD3-215ENST00000560424 PPA1Q15181 289 aa8.21□□□□□ -1.1
SMAD3-215ENST00000560424 TRIP10Q15642 601 aa8.21□□□□□ -1.1
SMAD3-215ENST00000560424 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa8.21□□□□□ -1.1
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SMAD3-215ENST00000560424 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
SMAD3-215ENST00000560424 SSX8Q7RTT4 187 aa8.21□□□□□ -1.1
SMAD3-215ENST00000560424 KRT73Q86Y46 540 aa8.21□□□□□ -1.1
SMAD3-215ENST00000560424 FAM86B1Q8N7N1 296 aa8.21□□□□□ -1.1
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SMAD3-215ENST00000560424 OR10D3Q8NH80 312 aa8.21□□□□□ -1.1
SMAD3-215ENST00000560424 FBXO30Q8TB52 745 aa8.21□□□□□ -1.1
SMAD3-215ENST00000560424 ADAMTS15Q8TE58 950 aa8.21□□□□□ -1.1
SMAD3-215ENST00000560424 LRTOMTQ8WZ04 291 aa8.21□□□□□ -1.1
SMAD3-215ENST00000560424 KAT2AQ92830 837 aa8.21□□□□□ -1.1
SMAD3-215ENST00000560424 TAMM41Q96BW9 452 aa8.21□□□□□ -1.1
SMAD3-215ENST00000560424 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
SMAD3-215ENST00000560424 C7orf34Q96L11 122 aa8.21□□□□□ -1.1
SMAD3-215ENST00000560424 OR7D2Q96RA2 312 aa8.21□□□□□ -1.1
SMAD3-215ENST00000560424 DHRS9Q9BPW9 319 aa8.21□□□□□ -1.1
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