RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552294.1

CTDSP2-208, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP2, Length 436 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-208ENST00000552294 COMTD1Q86VU5 262 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 ANKRD46Q86W74 232 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF584Q8IVC4 421 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 C10orf107Q8IVU9 208 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF540Q8NDQ6 660 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF563Q8TA94 476 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 AGR3Q8TD06 166 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 OR5P2Q8WZ92 322 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 COQ8BQ96D53 544 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 PKP2Q99959 881 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 HOXD1Q9GZZ0 328 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF442Q9H7R0 627 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF665Q9H7R5 613 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 REV1Q9UBZ9 1251 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 TBK1Q9UHD2 729 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF180Q9UJW8 692 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 STK38LQ9Y2H1 464 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 CORINQ9Y5Q5 1042 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSP2-208ENST00000552294 FTCDNL1E5RQL4 147 aa5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 H3BNH8 94 aa5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 TRAPPC2LH3BP13 241 aa5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 ZSCAN12O43309 604 aa5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 FRS3O43559 492 aa5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 PLIN3O60664 434 aa5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 IGHV2-5P01817 119 aa5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 SHBGP04278 402 aa5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 CBR1P16152 277 aa5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 TAC1P20366 129 aa5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 MATN1P21941 496 aa5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 NR4A1P22736 598 aa5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 SOAT1P35610 550 aa5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 SLC1A3P43003 542 aa5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 KHKP50053 298 aa5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 SERPINB9P50453 376 aa5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 CCL8P80075 99 aa5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 LCN2P80188 198 aa5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 CAV1Q03135 178 aa5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 EGR4Q05215 589 aa5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 DAG1Q14118 895 aa5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 PCLAFQ15004 111 aa5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 CHI3L2Q15782 390 aa5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 FXNQ16595 210 aa5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 CEACAM16Q2WEN9 425 aa5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 SPDYE7PQ495Y7 208 aa5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 XKR7Q5GH72 579 aa5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 COX20Q5RI15 118 aa5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 PAQR6Q6TCH4 344 aa5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 GRINAQ7Z429 371 aa5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 DEFB108BQ8NET1 73 aa5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 ZFP28Q8NHY6 868 aa5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 XAGE5Q8WWM1 108 aa5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 MECRQ9BV79 373 aa5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 PTDSS2Q9BVG9 487 aa5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 SAP130Q9H0E3 1048 aa5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 SLC38A1Q9H2H9 487 aa5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 OR51B6Q9H340 312 aa5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 CRLF2Q9HC73 371 aa5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 GPR35Q9HC97 309 aa5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 DYNLRB1Q9NP97 96 aa5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 SERINC1Q9NRX5 453 aa5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 SLC6A13Q9NSD5 602 aa5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 TMEM45AQ9NWC5 275 aa5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 OXSMQ9NWU1 459 aa5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 ADPRHL2Q9NX46 363 aa5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 TRAPPC4Q9Y296 219 aa5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 WNK1Q9H4A3 2382 aa5.77□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 CCDC151A5D8V7 595 aa5.76□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 HMGN4O00479 90 aa5.76□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 AZIN1O14977 448 aa5.76□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 NPIPB7O75200 414 aa5.76□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 GLRA3O75311 464 aa5.76□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 STX11O75558 287 aa5.76□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa5.76□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 G6PDP11413 515 aa5.76□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 MAKP20794 623 aa5.76□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 CBLP22681 906 aa5.76□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 CDKN2CP42773 168 aa5.76□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 CLDN17P56750 224 aa5.76□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 ETF1P62495 437 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 SLC35A1P78382 337 aa5.76□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 KCNJ10P78508 379 aa5.76□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 SLC9A3R2Q15599 337 aa5.76□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 PGS1Q32NB8 556 aa5.76□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 C6orf136Q5SQH8 315 aa5.76□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 IL23RQ5VWK5 629 aa5.76□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 CARD17Q5XLA6 110 aa5.76□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms