RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 SERPINA12Q8IW75 414 aa7.88□□□□□ -1.15
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PTPRB-208ENST00000550358 SLC35A4Q96G79 324 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF681Q96N22 645 aa7.88□□□□□ -1.15
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PTPRB-208ENST00000550358 CARTPTQ16568 116 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 NANPQ8TBE9 248 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 MIB2Q96AX9 1013 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 TIMD4Q96H15 378 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 RTL8AQ9BWD3 113 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
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