RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523636.5

PABPC1-223, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 5

Gene PABPC1, Length 818 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-223	ENST00000523636	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	BDH1	Q02338	343 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	DPYSL3	Q14195	570 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	KRT81	Q14533	505 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	IL13RA2	Q14627	380 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	TMED2	Q15363	201 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	CARD16	Q5EG05	197 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	FBXL22	Q6P050	247 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	DET1	Q7L5Y6	550 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	CHSY1	Q86X52	802 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	SNX31	Q8N9S9	440 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	ACTL9	Q8TC94	416 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	HAS2	Q92819	552 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	RFT1	Q96AA3	541 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	IP6K3	Q96PC2	410 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	TSC22D3	Q99576	134 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	CIB1	Q99828	191 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	IL22	Q9GZX6	179 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	LHPP	Q9H008	270 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	DRC3	Q9H069	523 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	FN3K	Q9H479	309 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	COG4	Q9H9E3	785 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	SAR1A	Q9NR31	198 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	MS4A12	Q9NXJ0	267 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	PAK5	Q9P286	719 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	PKP3	Q9Y446	797 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	OR6C70	A6NIJ9	312 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636		E7ESA3	106 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636		H7C0C1	242 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	WWP2	O00308	870 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	OGG1	O15527	345 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	KDELR3	O43731	214 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	HCN1	O60741	890 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	NXPH3	O95157	252 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	ATP6V1G2	O95670	118 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	JCHAIN	P01591	159 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	APOE	P02649	317 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	STATH	P02808	62 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	ADH4	P08319	380 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	FCGR2A	P12318	317 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	TAC1	P20366	129 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	HTR2A	P28223	471 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	ACADL	P28330	430 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	EPHA3	P29320	983 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	MIP	P30301	263 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	PTH2R	P49190	550 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	SERPINB9	P50453	376 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	RAD23B	P54727	409 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	SEC61G	P60059	68 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	INCA1	Q0VD86	236 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	ADIG	Q0VDE8	80 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	FUT7	Q11130	342 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	ACOX1	Q15067	660 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	TGFBI	Q15582	683 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	GPR157	Q5UAW9	335 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	IL23R	Q5VWK5	629 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	RAET1L	Q5VY80	246 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PABPC1-223	ENST00000523636	C16orf89	Q6UX73	402 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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