RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 GSX2Q9BZM3 304 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 ACOT13Q9NPJ3 140 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 CDC14CA4D256 554 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 PRAMEF25A6NGN4 478 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 METTL15A6NJ78 407 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 PHYHO14832 338 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 FFAR1O14842 300 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 SSX4O60224 188 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 PLOD3O60568 738 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 CRYABP02511 175 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 DBIP07108 87 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 CTSBP07858 339 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 SBK2P0C263 348 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 NME1P15531 152 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 BMI1P35226 326 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 GCGRP47871 477 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 GIPRP48546 466 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 MAB21L1Q13394 359 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 MADCAM1Q13477 382 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 NSDHLQ15738 373 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 DNAJC22Q8N4W6 341 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 LINC00471Q8N535 108 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 DEFB123Q8N688 67 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 NANOGP1Q8N7R0 232 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 OR4D11Q8NGI4 311 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 OR5M3Q8NGP4 307 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 OR51Q1Q8NH59 317 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 UBASH3BQ8TF42 649 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 ROBO4Q8WZ75 1007 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 FCGR1BQ92637 280 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 GGHQ92820 318 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 LGALS12Q96DT0 336 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 C14orf144Q96I85 54 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 CD180Q99467 661 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 SDF2Q99470 211 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 MGLLQ99685 303 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 WFDC6Q9BQY6 131 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 C2orf88Q9BSF0 95 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 DPH1Q9BZG8 443 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 DNTTIP1Q9H147 329 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 DCSTAMPQ9H295 470 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 OSGIN1Q9UJX0 560 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 SSR3Q9UNL2 185 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 MED31Q9Y3C7 131 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 A0A087WUU8 490 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 GXYLT2A0PJZ3 443 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 FAM86C2PA6NEL3 165 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 CSTAP01040 98 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 RAB3BP20337 219 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 BCKDHBP21953 392 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 MYL9P24844 172 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 MSX1P28360 303 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 BMP8BP34820 402 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 CAPZBP47756 277 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 CDH11P55287 796 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 RAB38P57729 211 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 MLC1Q15049 377 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 SPANXN2Q5MJ10 180 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 PHF19Q5T6S3 580 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 PGBD2Q6P3X8 592 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 SLC36A4Q6YBV0 504 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 SPEM1Q8N4L4 309 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 NT5CQ8TCD5 201 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 NEDD4LQ96PU5 975 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 OR51B6Q9H340 312 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 SLC22A11Q9NSA0 550 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 MED9Q9NWA0 146 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 ALG5Q9Y673 324 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 SDK2Q58EX2 2172 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 C17orf105B2RV13 164 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 NDUFS8O00217 210 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 OPN1MWP04001 364 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 OPN1MW2P0DN77 364 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 OPN1MW3P0DN78 364 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP7.23□□□□□ -1.252e-6■■■■■ 39.4
TRPS1-208ENST00000519076 C14orf28Q4W4Y0 310 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 PRR22Q8IZ63 422 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 CA13Q8N1Q1 262 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM52Q8NDY8 209 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 ST7LQ8TDW4 575 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 LYRM4Q9HD34 91 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 ASCL3Q9NQ33 180 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 SEC14L4Q9UDX3 406 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa7.23□□□□□ -1.25
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