RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000501011.6

RAB30-AS1-201, Transcript of RAB30 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAB30-AS1, Length 607 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CLPTM1LQ96KA5 538 aa10.71□□□□□ -0.69
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TAPBPLQ9BX59 468 aa10.71□□□□□ -0.69
RAB30-AS1-201ENST00000501011 POTEKPQ9BYX7 375 aa10.71□□□□□ -0.69
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GORASP2Q9H8Y8 452 aa10.71□□□□□ -0.69
RAB30-AS1-201ENST00000501011 UBTD1Q9HAC8 227 aa10.71□□□□□ -0.69
RAB30-AS1-201ENST00000501011 EGFL7Q9UHF1 273 aa10.71□□□□□ -0.69
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PRDM4Q9UKN5 801 aa10.71□□□□□ -0.69
RAB30-AS1-201ENST00000501011 OTOGQ6ZRI0 2925 aa10.7□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GPR171O14626 319 aa10.7□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GOSR1O95249 250 aa10.7□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 AHSA1O95433 338 aa10.7□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PPP3CBP16298 524 aa10.7□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NCK1P16333 377 aa10.7□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CBLP22681 906 aa10.7□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 IGHV1-2P23083 117 aa10.7□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RPS5P46782 204 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RASSF2P50749 326 aa10.7□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MAP2K6P52564 334 aa10.7□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MS4A2Q01362 244 aa10.7□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ITGADQ13349 1161 aa10.7□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 KEAP1Q14145 624 aa10.7□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PDK3Q15120 406 aa10.7□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NRF1Q16656 503 aa10.7□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CYBRD1Q53TN4 286 aa10.7□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GLYATQ6IB77 296 aa10.7□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PAQR6Q6TCH4 344 aa10.7□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 Q6ZT83 130 aa10.7□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CCDC121Q6ZUS5 278 aa10.7□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CBLL1Q75N03 491 aa10.7□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GPAT4Q86UL3 456 aa10.7□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 STEAP2Q8NFT2 490 aa10.7□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 APH1AQ96BI3 265 aa10.7□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PLPPR2Q96GM1 343 aa10.7□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ARHGDIGQ99819 225 aa10.7□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 THTPAQ9BU02 230 aa10.7□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 HDHD5Q9BXW7 423 aa10.7□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PCDHAC1Q9H158 963 aa10.7□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SELENONQ9NZV5 590 aa10.7□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ACTR3BQ9P1U1 418 aa10.7□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SNX13Q9Y5W8 968 aa10.7□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 AQP7P3A6NL99 342 aa10.69□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ACOT8O14734 319 aa10.69□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ARPC2O15144 300 aa10.69□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 KLF4O43474 513 aa10.69□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TPST2O60704 377 aa10.69□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PDE5AO76074 875 aa10.69□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ATE1O95260 518 aa10.69□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PLAUP00749 431 aa10.69□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RAF1P04049 648 aa10.69□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 LOXP28300 417 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SLC16A1P53985 500 aa10.69□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SELENOWP63302 87 aa10.69□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 EGR4Q05215 589 aa10.69□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FAPQ12884 760 aa10.69□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SLC17A1Q14916 467 aa10.69□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 P2RY6Q15077 328 aa10.69□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 OR1Q1Q15612 314 aa10.69□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TAB1Q15750 504 aa10.69□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ALG10BQ5I7T1 473 aa10.69□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 C9orf135Q5VTT2 229 aa10.69□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TMEM225Q6GV28 225 aa10.69□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 KDM8Q8N371 416 aa10.69□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 OR9K2Q8NGE7 335 aa10.69□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 OR4D11Q8NGI4 311 aa10.69□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 STK35Q8TDR2 534 aa10.69□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SLC26A7Q8TE54 656 aa10.69□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RASSF5Q8WWW0 418 aa10.69□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NINJ1Q92982 152 aa10.69□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TRIM2Q9C040 744 aa10.69□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MUC13Q9H3R2 512 aa10.69□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 EVA1AQ9H8M9 152 aa10.69□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TMEM27Q9HBJ8 222 aa10.69□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa10.69□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 EDARQ9UNE0 448 aa10.69□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa10.69□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GSTA4O15217 222 aa10.68□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NPIPB7O75200 414 aa10.68□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RAD51DO75771 328 aa10.68□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 IFNA14P01570 189 aa10.68□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CDH12P55289 794 aa10.68□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 IL1RL1Q01638 556 aa10.68□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TESK1Q15569 626 aa10.68□□□□□ -0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NPTX1Q15818 432 aa10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms