RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497368.1

UBE3C-208, Transcript of ubiquitin protein ligase E3C, human

TSL 2

Gene UBE3C, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE3C-208	ENST00000497368	HSPA4L	O95757	839 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	YES1	P07947	543 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	PRG2	P13727	222 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	PPP3CB	P16298	524 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	PRPS1L1	P21108	318 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	FPR1	P21462	350 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	MATN1	P21941	496 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	SDHA	P31040	664 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	ACVR1B	P36896	505 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	KCNJ5	P48544	419 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	CCR4	P51679	360 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	CTBP2	P56545	445 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	NME5	P56597	212 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	CARD18	P57730	90 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	RAC3	P60763	192 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	GPR68	Q15743	365 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	RNF151	Q2KHN1	245 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	SMU1	Q2TAY7	513 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	TMPPE	Q6ZT21	453 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368		Q6ZT83	130 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	RNF130	Q86XS8	419 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF614	Q8N883	585 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	OR9I1	Q8NGQ6	314 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	ST8SIA1	Q92185	356 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	MOAP1	Q96BY2	351 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	OR5B2	Q96R09	309 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	WDR55	Q9H6Y2	383 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	EXOSC3	Q9NQT5	275 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	GLRX2	Q9NS18	164 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	FLVCR1	Q9Y5Y0	555 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	AGAP5	A6NIR3	686 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	OR5H1	A6NKK0	313 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368		E9PBE3	544 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	CASK	O14936	926 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	BIRC5	O15392	142 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	FRS3	O43559	492 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	GPRIN2	O60269	458 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	NPIPB7	O75200	414 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	STX11	O75558	287 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	RAD51D	O75771	328 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	LY6H	O94772	140 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	PRKD3	O94806	890 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	PMS2P2	O95744	297 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	CHEK2	O96017	543 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	CSTA	P01040	98 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	ATP6V1C1	P21283	382 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	UQCRC2	P22695	453 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	SLC1A6	P48664	564 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	EGR4	Q05215	589 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	MERTK	Q12866	999 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	EPS8	Q12929	822 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	ITGAD	Q13349	1161 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	CBFB	Q13951	182 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	PDK3	Q15120	406 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	GABRA6	Q16445	453 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	PGS1	Q32NB8	556 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	KRT71	Q3SY84	523 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	FAM174B	Q3ZCQ3	159 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	GRINA	Q7Z429	371 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	VRK2	Q86Y07	508 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBE3C-208	ENST00000497368	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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