RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496574.6

PKD1-222, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 4,419 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-222	ENST00000496574	ADH1B	P00325	375 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	GLO1	Q04760	184 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	KIAA0040	Q15053	153 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	SSX2	Q16385	188 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	NMNAT3	Q96T66	252 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	LEUTX	A8MZ59	168 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	DVL2	O14641	736 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	LDB3	O75112	727 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	OR2F2	O95006	317 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	SLC2A10	O95528	541 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	SLC26A5	P58743	744 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	OR2F1	Q13607	317 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	C14orf79	Q96F83	325 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	RGS11	O94810	467 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	HTR3B	O95264	441 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	IFNA10	P01566	189 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	IFNA4	P05014	189 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	MAOB	P27338	520 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	CRABP1	P29762	137 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	C12orf73	Q69YU5	71 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	SSX9	Q7RTT3	188 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	SMARCD2	Q92925	531 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	CA5B	Q9Y2D0	317 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	ETHE1	O95571	254 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	PLCXD2	Q0VAA5	305 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	CMIP	Q8IY22	773 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF709	Q8N972	641 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574		K7EPK0	472 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	KCNJ13	O60928	360 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	CPM	P14384	443 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	LIM2	P55344	173 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	SGCA	Q16586	387 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	CDH26	Q8IXH8	852 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	MMP21	Q8N119	569 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	TTC9	Q92623	222 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	NCDN	Q9UBB6	729 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	ITGB4	P16144	1822 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574		A0A0B4J203	849 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	ACR	P10323	421 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF250	P15622	560 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	EMP2	P54851	167 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	NIPAL3	Q6P499	406 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	COMTD1	Q86VU5	262 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	PEX11G	Q96HA9	241 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF304	Q9HCX3	659 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	NDRG3	Q9UGV2	375 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	RAB19	A4D1S5	217 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	SLC16A7	O60669	478 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	DIRAS3	O95661	229 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	S100A8	P05109	93 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	HTR2C	P28335	458 aa		13.1	□□□□□ -0.31

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