RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, human

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C4BPB-208	ENST00000492730	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		5.29	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		5.29	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	DHCR7	Q9UBM7	475 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		5.29	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	CHRNA9	Q9UGM1	479 aa		5.29	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	RARRES3	Q9UL19	164 aa		5.29	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	SSR3	Q9UNL2	185 aa		5.29	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	COPS3	Q9UNS2	423 aa		5.29	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		5.29	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	MED31	Q9Y3C7	131 aa		5.29	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		5.29	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		5.29	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	SPACA6	W5XKT8	324 aa		5.29	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730		A0A0G2JK05	382 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	C17orf105	B2RV13	164 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730		B4DXG7	233 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	TMEM150C	B9EJG8	249 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	KLK10	O43240	276 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	RNF13	O43567	381 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	OR2B3	O76000	313 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	SNX4	O95219	450 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	TIAF1	O95411	115 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	IL33	O95760	270 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	IL1A	P01583	271 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	IGKV3-11	P04433	115 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	PSKH1	P11801	424 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	FGF5	P12034	268 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF28	P17035	718 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	ALAS2	P22557	587 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	CD97	P48960	835 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	RORC	P51449	518 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	HSD17B7	P56937	341 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	OR12D2	P58182	307 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	EGR4	Q05215	589 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	STX4	Q12846	297 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	SELENBP1	Q13228	472 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	SKP2	Q13309	424 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	VWA2	Q5GFL6	755 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	RPTN	Q6XPR3	784 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	MED25	Q71SY5	747 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	CARF	Q8N187	725 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	GHDC	Q8N2G8	530 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	EXD3	Q8N9H8	876 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	POC5	Q8NA72	575 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	OR5J2	Q8NH18	312 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	OR4K13	Q8NH42	304 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	UFD1	Q92890	307 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	OTULIN	Q96BN8	352 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	SGTB	Q96EQ0	304 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	RBM18	Q96H35	190 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	TEAD3	Q99594	435 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	ATF6B	Q99941	703 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	ALG8	Q9BVK2	526 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	TMED9	Q9BVK6	235 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	TRIM2	Q9C040	744 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	CHRNA10	Q9GZZ6	450 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	SIAE	Q9HAT2	523 aa		5.28	□□□□□ -1.56
C4BPB-208	ENST00000492730	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		5.28	□□□□□ -1.56

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