RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 C16orf74Q96GX8 76 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 ZFP14Q9HCL3 533 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 KLHL28Q9NXS3 571 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 FANCIQ9NVI1 1328 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 HEATR9A2RTY3 570 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 HAT1O14929 419 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 TBPP20226 339 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 ARFRP1Q13795 201 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 DGUOKQ16854 277 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 BCL7AQ4VC05 210 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 Q6ZN92 141 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 PLA2G4DQ86XP0 818 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 OR10G3Q8NGC4 313 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 OR1L6Q8NGR2 347 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 KCNG3Q8TAE7 436 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 PLEKHA8Q96JA3 519 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 PANX2Q96RD6 677 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 PLGRKTQ9HBL7 147 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 HOXC10Q9NYD6 342 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 ASF1AQ9Y294 204 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 A6NIZ1 184 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 UPK3AO75631 287 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 LY6G6DO95868 133 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 TIMP1P01033 207 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 MMP1P03956 469 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 CMA1P23946 247 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 ZBTB25P24278 435 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 GLP1RP43220 463 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 KLK7P49862 253 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 RAP1BP61224 184 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 BEX3Q00994 111 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 ARMC12Q5T9G4 340 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 FHL5Q5TD97 284 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 KDM7AQ6ZMT4 941 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 SLC26A11Q86WA9 606 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 CEND1Q8N111 149 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 TPRX1Q8N7U7 411 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 PYROXD1Q8WU10 500 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 CMTM7Q96FZ5 175 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 C12orf42Q96LP6 360 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 P2RY13Q9BPV8 354 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 VPS37BQ9H9H4 285 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 SLC7A8Q9UHI5 535 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 E9PBE3 544 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 SGK1O00141 431 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 ERLIN1O75477 346 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 TNNI1P19237 187 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 YAP1P46937 504 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 BBS5Q8N3I7 341 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 ACOT4Q8N9L9 421 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 OR2L3Q8NG85 312 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 C7orf33Q8WU49 177 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 KCNA7Q96RP8 456 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 ACTR6Q9GZN1 396 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 MFFQ9GZY8 342 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 GBA3Q9H227 469 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 NARFLQ9H6Q4 476 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 AIG1Q9NVV5 245 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 GIN1Q9NXP7 522 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 KCNIP1Q9NZI2 227 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 B4GALT7Q9UBV7 327 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 MMP23AO75900 390 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 P04436 131 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 COX7A1P24310 79 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 CXCR2P25025 360 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 FDFT1P37268 417 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 VHLP40337 213 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 PLP1P60201 277 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 TIMM10P62072 90 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 ERVK-25P63136 954 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM107Q6UX40 140 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 NKAPP1Q8N9T2 125 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 FAM110BQ8TC76 370 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 NUP58Q9BVL2 599 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 GPR61Q9BZJ8 451 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 C20orf85Q9H1P6 137 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 SLC25A22Q9H936 323 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 IL26Q9NPH9 171 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 HDAC3O15379 428 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 OR7A10O76100 309 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM50AO95807 157 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 CRYGBP07316 175 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 TOP1P11387 765 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
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