RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490425.1

NISCH-214, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 5

Gene NISCH, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-214ENST00000490425 MFSD8Q8NHS3 518 aa10.6□□□□□ -0.71
NISCH-214ENST00000490425 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
NISCH-214ENST00000490425 SLC26A7Q8TE54 656 aa10.6□□□□□ -0.71
NISCH-214ENST00000490425 HSD17B8Q92506 261 aa10.6□□□□□ -0.71
NISCH-214ENST00000490425 SLC38A4Q969I6 547 aa10.6□□□□□ -0.71
NISCH-214ENST00000490425 TAAR8Q969N4 342 aa10.6□□□□□ -0.71
NISCH-214ENST00000490425 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
NISCH-214ENST00000490425 ACANP16112 2415 aa10.6□□□□□ -0.71
NISCH-214ENST00000490425 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-214ENST00000490425 A0A087WUJ7 227 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-214ENST00000490425 CIB4A0PJX0 185 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-214ENST00000490425 M0R082 166 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-214ENST00000490425 RAD51DO75771 328 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-214ENST00000490425 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
NISCH-214ENST00000490425 C8BP07358 591 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-214ENST00000490425 ITGA5P08648 1049 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-214ENST00000490425 GGT1P19440 569 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-214ENST00000490425 TNFRSF1BP20333 461 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-214ENST00000490425 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
NISCH-214ENST00000490425 GRPRP30550 384 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-214ENST00000490425 LSP1P33241 339 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-214ENST00000490425 LTBQ06643 244 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-214ENST00000490425 LGALS3BPQ08380 585 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-214ENST00000490425 ENTPD8Q5MY95 495 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-214ENST00000490425 TSPO2Q5TGU0 170 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-214ENST00000490425 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-214ENST00000490425 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
NISCH-214ENST00000490425 CREB3L2Q70SY1 520 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-214ENST00000490425 AAED1Q7RTV5 226 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-214ENST00000490425 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
NISCH-214ENST00000490425 ZNF417Q8TAU3 575 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-214ENST00000490425 TMEM45BQ96B21 275 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-214ENST00000490425 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
NISCH-214ENST00000490425 EVA1AQ9H8M9 152 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-214ENST00000490425 SLC7A10Q9NS82 523 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-214ENST00000490425 PARPBPQ9NWS1 579 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-214ENST00000490425 ASB6Q9NWX5 421 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-214ENST00000490425 CMTM6Q9NX76 183 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-214ENST00000490425 UPB1Q9UBR1 384 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-214ENST00000490425 MALT1Q9UDY8 824 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-214ENST00000490425 EDARQ9UNE0 448 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-214ENST00000490425 RASD1Q9Y272 281 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-214ENST00000490425 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 A0A1W2PR80 420 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 FAM220BPB1ANY3 271 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 LRRN3E7EW58 273 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 PDLIM1O00151 329 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 FMO6PO60774 539 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 VAMP5O95183 116 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 LYPD3O95274 346 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 THY1P04216 161 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 CD53P19397 219 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 SELENOPP49908 381 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 GNGT1P63211 74 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 IL1RL1Q01638 556 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 VEZF1Q14119 521 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 PPA1Q15181 289 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 FAM69AQ5T7M9 428 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 ERICH5Q6P6B1 374 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 C5orf46Q6UWT4 87 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 WDR88Q6ZMY6 472 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 CPLX4Q7Z7G2 160 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 CARM1Q86X55 608 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 EPHX4Q8IUS5 362 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 SLC15A3Q8IY34 581 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 C10orf53Q8N6V4 93 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 OR2T12Q8NG77 320 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 FOXC2Q99958 501 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 MYLK2Q9H1R3 596 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 GMNCA6NCL1 334 aa10.57□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 OR5H1A6NKK0 313 aa10.57□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 OR2T1O43869 369 aa10.57□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 SNX3O60493 162 aa10.57□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 FZD7O75084 574 aa10.57□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 HPRP00739 348 aa10.57□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 BGLAPP02818 100 aa10.57□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 SLC7A2P52569 658 aa10.57□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 NR1H2P55055 460 aa10.57□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 CLDN17P56750 224 aa10.57□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 GABRA6Q16445 453 aa10.57□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 ACKR1Q16570 336 aa10.57□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 DEFB113Q30KQ7 82 aa10.57□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 CYBRD1Q53TN4 286 aa10.57□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 TIMM23BQ5SRD1 257 aa10.57□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 NIPAL3Q6P499 406 aa10.57□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 ZNF613Q6PF04 617 aa10.57□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 LINC00114Q6XXX2 140 aa10.57□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 SPNS3Q6ZMD2 512 aa10.57□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 MICU2Q8IYU8 434 aa10.57□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 OR52N5Q8NH56 324 aa10.57□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa10.57□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 RASSF5Q8WWW0 418 aa10.57□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 PROX1Q92786 737 aa10.57□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 NEUROG1Q92886 237 aa10.57□□□□□ -0.72
NISCH-214ENST00000490425 MBD6Q96DN6 1003 aa10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms