RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488985.1

RPS6KA1-208, Transcript of ribosomal protein S6 kinase A1, human

TSL 3

Gene RPS6KA1, Length 304 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS6KA1-208	ENST00000488985	INPP1	P49441	399 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	PITPNA	Q00169	270 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	HSF2	Q03933	536 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	CHRNE	Q04844	493 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	MFAP5	Q13361	173 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	NSDHL	Q15738	373 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	BTBD16	Q32M84	506 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	TMEM107	Q6UX40	140 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	RTL4	Q6ZR62	310 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	RBM45	Q8IUH3	476 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	MMP21	Q8N119	569 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	FAM83F	Q8NEG4	500 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	OR5T3	Q8NGG3	340 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	OR5D16	Q8NGK9	328 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	ENKUR	Q8TC29	256 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	SLC9A6	Q92581	669 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	GIMAP5	Q96F15	307 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	LPAR4	Q99677	370 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	TRIM2	Q9C040	744 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	ACTR6	Q9GZN1	396 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	RNF121	Q9H920	327 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	TMEM27	Q9HBJ8	222 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	ABCB9	Q9NP78	766 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	ING3	Q9NXR8	418 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	EMC3	Q9P0I2	261 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985		A0A1W2PQ09	198 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985		J3QRE1	110 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	LRRTM2	O43300	516 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	PLPP2	O43688	288 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	ARL6IP5	O75915	188 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	GPR75	O95800	540 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	EPPIN	O95925	133 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	RNH1	P13489	461 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	GNLY	P22749	145 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	MYL9	P24844	172 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	LCN1	P31025	176 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	GALNS	P34059	522 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	TGFBR1	P36897	503 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	RFX3	P48380	749 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	ATP12A	P54707	1039 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	ACTA2	P62736	377 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	ACTG2	P63267	376 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	BTN3A2	P78410	334 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	LGALS3BP	Q08380	585 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	FUT5	Q11128	374 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	GALE	Q14376	348 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	PCOLCE	Q15113	449 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	ZNF79	Q15937	498 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	EXT1	Q16394	746 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	CCDC58	Q4VC31	144 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	PYDC2	Q56P42	97 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	FHL5	Q5TD97	284 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	HBM	Q6B0K9	141 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	C22orf42	Q6IC83	251 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	TMEM205	Q6UW68	189 aa		7.37	□□□□□ -1.23

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