RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483564.5

GABRE-208, Transcript of gamma-aminobutyric acid type A receptor epsilon subunit, humanhuman

TSL 3

Gene GABRE, Length 2,747 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRE-208ENST00000483564 OR10H2O60403 315 aa8.5□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 MT-ND5P03915 603 aa8.5□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 ASGR2P07307 311 aa8.5□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 ZGLP1P0C6A0 271 aa8.5□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 SAGP10523 405 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 TYRP14679 529 aa8.5□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 CPT2P23786 658 aa8.5□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 AVPR2P30518 371 aa8.5□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 BDH1Q02338 343 aa8.5□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 FUT5Q11128 374 aa8.5□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 COTL1Q14019 142 aa8.5□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 GAMTQ14353 236 aa8.5□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 ADAM5Q6NVV9 412 aa8.5□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 OR56A3Q8NH54 315 aa8.5□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 RAB3CQ96E17 227 aa8.5□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 ARSGQ96EG1 525 aa8.5□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 AMDHD1Q96NU7 426 aa8.5□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 NDC1Q9BTX1 674 aa8.5□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 FAM117AQ9C073 453 aa8.5□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 LAT2Q9GZY6 243 aa8.5□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 SLC25A18Q9H1K4 315 aa8.5□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 UBQLN3Q9H347 655 aa8.5□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 KLHL31Q9H511 634 aa8.5□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 TMEM138Q9NPI0 162 aa8.5□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 LHX9Q9NQ69 397 aa8.5□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 ABRACLQ9P1F3 81 aa8.5□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 ICKQ9UPZ9 632 aa8.5□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 FAM96BQ9Y3D0 163 aa8.5□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 OR51B4Q9Y5P0 310 aa8.5□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 A0A1W2PR64 198 aa8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 A0A1W2PRV1 198 aa8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 MYADML2A6NDP7 307 aa8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 ANKRD61A6NGH8 418 aa8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 A6NLC8 198 aa8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 AP4M1O00189 453 aa8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 KCNAB3O43448 404 aa8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 SLCO2B1O94956 709 aa8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 SERPIND1P05546 499 aa8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 UBBP0CG47 229 aa8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 IL9P15248 144 aa8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 AGAP20933 346 aa8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 VAMP1P23763 118 aa8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 PTH2RP49190 550 aa8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 F2RL1P55085 397 aa8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 UBA52P62987 128 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 ZNF85Q03923 595 aa8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 TP53I3Q53FA7 332 aa8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 ELFN2Q5R3F8 820 aa8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 NIPAL3Q6P499 406 aa8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 TMEM200AQ86VY9 491 aa8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 ARL14Q8N4G2 192 aa8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 AMER3Q8N944 861 aa8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 CYB561A3Q8NBI2 242 aa8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 OR2T33Q8NG76 320 aa8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 OR2AK2Q8NG84 335 aa8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 PAQR8Q8TEZ7 354 aa8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 OR5P2Q8WZ92 322 aa8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 SMPDL3BQ92485 455 aa8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 OSTF1Q92882 214 aa8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 TM4SF18Q96CE8 201 aa8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 F2RL3Q96RI0 385 aa8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 GPR62Q9BZJ7 368 aa8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 TAS2R10Q9NYW0 307 aa8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 KLHL9Q9P2J3 617 aa8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 P2RX2Q9UBL9 471 aa8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 FBXL3Q9UKT7 428 aa8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 A0A087WV48 116 aa8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 TMEM72A0PK05 275 aa8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 GLOD5A6NK44 160 aa8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 GABARAPH6UMI1 98 aa8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 CTDSPLO15194 276 aa8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 PPM1DO15297 605 aa8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 MBTPS2O43462 519 aa8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 NDUFB6O95139 128 aa8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
GABRE-208ENST00000483564 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms