RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477970.1

PTPRF-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRF, Length 3,321 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-212ENST00000477970 FBLP22087 321 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 MST1P26927 711 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 RPL4P36578 427 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 CXCL12P48061 93 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 CFHR1Q03591 330 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 SQSTM1Q13501 440 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 IL18Q14116 193 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 KCNJ8Q15842 424 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 HSPB2Q16082 182 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 NKAIN2Q5VXU1 208 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 DEFB119Q8N690 84 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 PLPP5Q8NEB5 264 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 CTRCQ99895 268 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 TGIF2Q9GZN2 237 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF304Q9HCX3 659 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 NCDNQ9UBB6 729 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 OR2W5A6NFC9 320 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 ALG1L2C9J202 215 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 PNLIPP16233 465 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 MAOBP27338 520 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 PYCR1P32322 319 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 NR4A2P43354 598 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 PNLIPRP2P54317 469 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 EGR4Q05215 589 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 APOOLQ6UXV4 268 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF321PQ8N8H1 164 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 LMF1Q96S06 567 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF221Q9UK13 617 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 A0A1B0GX78 115 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 OIP5O43482 229 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 GYPBP06028 91 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 KIR2DL3P43628 341 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 GDI2P50395 445 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 OR1D5P58170 312 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP11.12□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 SLC3A1Q07837 685 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 P2RY14Q15391 338 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 IDNKQ5T6J7 187 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 GPR139Q6DWJ6 353 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 SLC16A9Q7RTY1 509 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 OR1N1Q8NGS0 311 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 THAP4Q8WY91 577 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 FRMD6Q96NE9 622 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 NMNAT3Q96T66 252 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 NUDT9Q9BW91 350 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 MAU2Q9Y6X3 613 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 SMIM30A4D0T7 59 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 NOTOA8MTQ0 251 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 GIMD1P0DJR0 217 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 RAB3BP20337 219 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 KCNAB1Q14722 419 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 TAB1Q15750 504 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 C9orf40Q8IXQ3 194 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 TSLPQ969D9 159 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 PHOX2BQ99453 314 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 NANSQ9NR45 359 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 TRIOO75962 3097 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 A0A0C4DFX4 3053 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 TALDO1P37837 337 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 ARL4DP49703 201 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 CLDN20P56880 219 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 WDR45BQ5MNZ6 344 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 RFLNBQ8N5W9 214 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 MOSPD2Q8NHP6 518 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 ENKURQ8TC29 256 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 WWTR1Q9GZV5 400 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 MARCH7Q9H992 704 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 EXTL2Q9UBQ6 330 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 LYRM1O43325 122 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 ATP6V1G1O75348 118 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 MT-ATP6P00846 226 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 CSF2RBP32927 897 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 OR1D4P47884 311 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 QPRTQ15274 297 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 TP53I3Q53FA7 332 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 ALG10Q5BKT4 473 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 CEP78Q5JTW2 689 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 PYHIN1Q6K0P9 492 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 CBLN3Q6UW01 205 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 JAZF1Q86VZ6 243 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 SLC35F3Q8IY50 421 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 GPR135Q8IZ08 494 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 SNX33Q8WV41 574 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 ST6GAL2Q96JF0 529 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRF-212ENST00000477970 FAM25AB3EWG3 89 aa11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.5 ms