RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477563.6

RBBP4-211, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, humanhuman

TSL 5

Gene RBBP4, Length 544 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4-211ENST00000477563 SFTPDP35247 375 aa6.71□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 NME5P56597 212 aa6.71□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 PDK3Q15120 406 aa6.71□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 RGNQ15493 299 aa6.71□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 MAPK14Q16539 360 aa6.71□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 SYPL1Q16563 259 aa6.71□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 GPAT3Q53EU6 434 aa6.71□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 C6orf10Q5SRN2 563 aa6.71□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa6.71□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF614Q8N883 585 aa6.71□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 GATSQ8NAP1 163 aa6.71□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 OR9I1Q8NGQ6 314 aa6.71□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 FBXO27Q8NI29 283 aa6.71□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 BBS10Q8TAM1 723 aa6.71□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 WDR60Q8WVS4 1066 aa6.71□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 MUS81Q96NY9 551 aa6.71□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 INPP5KQ9BT40 448 aa6.71□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 CCDC106Q9BWC9 280 aa6.71□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 TMEM38AQ9H6F2 299 aa6.71□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF446Q9NWS9 450 aa6.71□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa6.71□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa6.71□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 SLC25A15Q9Y619 301 aa6.71□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 BBIP1A8MTZ0 92 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 EVPLLA8MZ36 301 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 NPIPA7E9PJI5 369 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 TCF21O43680 179 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 FZD7O75084 574 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 PMS2P2O95744 297 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 NPIPA8P0DM63 369 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 IL7RP16871 459 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 GPX2P18283 190 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 EDNRAP25101 427 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 SLC7A1P30825 629 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 PRKAR1BP31321 381 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 SLC1A3P43003 542 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 CRATP43155 626 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 NR4A2P43354 598 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 FABP6P51161 128 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 SESN3P58005 492 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 PLAURQ03405 335 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 CHRNEQ04844 493 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 RBBP4Q09028 425 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 MAPK11Q15759 364 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 STK11Q15831 433 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 MST1LQ2TV78 715 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 C11orf91Q3C1V1 193 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 SYT14P1Q58G82 188 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 COX20Q5RI15 118 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 FBXW9Q5XUX1 488 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 KLHL17Q6TDP4 642 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 B3GLCTQ6Y288 498 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 SLC30A8Q8IWU4 369 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 CLEC4FQ8N1N0 589 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 ANKFN1Q8N957 763 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 SLC38A5Q8WUX1 472 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 ZFAND2BQ8WV99 257 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 RAB8BQ92930 207 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 VPS33AQ96AX1 596 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 BOD1Q96IK1 185 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 SPATA9Q9BWV2 254 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 ADAM19Q9H013 955 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 PIF1Q9H611 641 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 C12orf10Q9HB07 376 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 SLC6A13Q9NSD5 602 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 CCDC167Q9P0B6 97 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 CHRNA9Q9UGM1 479 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 TRAPPC4Q9Y296 219 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 TGP01266 2768 aa6.7□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 A0A0A6YYJ9 748 aa6.69□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa6.69□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa6.69□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 PRORSD1PA6NEY8 169 aa6.69□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 CFAP73A6NFT4 308 aa6.69□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 C9JVG2 144 aa6.69□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 PDLIM1O00151 329 aa6.69□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 NR5A2O00482 541 aa6.69□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 IGHA1P01876 353 aa6.69□□□□□ -1.34
RBBP4-211ENST00000477563 GSNP06396 782 aa6.69□□□□□ -1.34
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