RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477448.1

SOBP-202, Transcript of sine oculis binding protein homolog, humanhuman

TSL 5

Gene SOBP, Length 1,535 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBP-202ENST00000477448 ANKRD60Q9BZ19 345 aa23.27■■□□□ 1.32
SOBP-202ENST00000477448 Q9H521 79 aa23.27■■□□□ 1.32
SOBP-202ENST00000477448 MCCC2Q9HCC0 563 aa23.27■■□□□ 1.32
SOBP-202ENST00000477448 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
SOBP-202ENST00000477448 TENM4Q6N022 2769 aa23.26■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 A0A1W2PNR3 127 aa23.26■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 LIPT2A6NK58 231 aa23.26■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 BCKDKO14874 412 aa23.26■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 FZD7O75084 574 aa23.26■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 RCBTB2O95199 551 aa23.26■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 GNAO1P09471 354 aa23.26■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 ACADSP16219 412 aa23.26■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 SMARCD3Q6STE5 483 aa23.26■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 SMPDL3BQ92485 455 aa23.26■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 SAMD8Q96LT4 415 aa23.26■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 HIF3AQ9Y2N7 669 aa23.26■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 GJE1A6NN92 205 aa23.25■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 TFECO14948 347 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 TSPAN19P0C672 248 aa23.25■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 GRPRP30550 384 aa23.25■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 MFSD13AQ14CX5 517 aa23.25■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 OR7A5Q15622 319 aa23.25■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 ANKDD1AQ495B1 522 aa23.25■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 GXYLT1Q4G148 440 aa23.25■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 TMEM236Q5W0B7 351 aa23.25■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 THSD4Q6ZMP0 1018 aa23.25■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 TRILQ7L0X0 811 aa23.25■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 KLHL15Q96M94 604 aa23.25■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 TAAR6Q96RI8 345 aa23.25■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 TAPBPLQ9BX59 468 aa23.25■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 ENKD1Q9H0I2 346 aa23.25■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 DEFB127Q9H1M4 99 aa23.25■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 TBC1D23Q9NUY8 699 aa23.25■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 IL20RAQ9UHF4 553 aa23.25■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 GMPPBQ9Y5P6 360 aa23.25■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 LIPGQ9Y5X9 500 aa23.25■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 BMP7P18075 431 aa23.24■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 NUP107P57740 925 aa23.24■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 CDK5Q00535 292 aa23.24■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa23.24■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 GGNQ86UU5 652 aa23.24■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 OR5J2Q8NH18 312 aa23.24■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 TSSK6Q9BXA6 273 aa23.24■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 SLC25A19Q9HC21 320 aa23.24■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 SEC14L4Q9UDX3 406 aa23.24■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 TRAPPC4Q9Y296 219 aa23.24■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 NDUFB2O95178 105 aa23.23■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 HIST1H2ABP04908 130 aa23.23■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 UQCRC1P31930 480 aa23.23■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 GGT2P36268 569 aa23.23■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 GIPRP48546 466 aa23.23■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 STARP49675 285 aa23.23■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 CLDN20P56880 219 aa23.23■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 GINS1Q14691 196 aa23.23■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 INAQ16352 499 aa23.23■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 CMPK2Q5EBM0 449 aa23.23■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa23.23■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 SLX4IPQ5VYV7 408 aa23.23■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 TMPPEQ6ZT21 453 aa23.23■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa23.23■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 IQCF1Q8N6M8 205 aa23.23■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 OR52L1Q8NGH7 329 aa23.23■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 HIST1H2ACQ93077 130 aa23.23■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 MUS81Q96NY9 551 aa23.23■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 ALKBH4Q9NXW9 302 aa23.23■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 CORINQ9Y5Q5 1042 aa23.23■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 NBASA2RRP1 2371 aa23.23■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 A0A0J9YW62 118 aa23.23■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa23.23■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 M0R082 166 aa23.23■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 PMS2P2O95744 297 aa23.23■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 MYF6P23409 242 aa23.23■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 DIO1P49895 249 aa23.23■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 PRPS1P60891 318 aa23.23■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 IL18R1Q13478 541 aa23.23■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 SGCBQ16585 318 aa23.23■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 ZNF691Q5VV52 312 aa23.23■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 SLC27A4Q6P1M0 643 aa23.23■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 SLC43A2Q8N370 569 aa23.23■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 SCAIQ8N9R8 606 aa23.23■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 NEIL3Q8TAT5 605 aa23.23■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 ZNF417Q8TAU3 575 aa23.23■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 CNBD2Q96M20 576 aa23.23■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 ASPNQ9BXN1 380 aa23.23■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 IGHG3P01860 377 aa23.22■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 AQP2P41181 271 aa23.22■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 LHX2P50458 406 aa23.22■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 MED21Q13503 144 aa23.22■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 OR4Q3Q8NH05 313 aa23.22■■□□□ 1.31
SOBP-202ENST00000477448 MOSPD2Q8NHP6 518 aa23.22■■□□□ 1.31
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