RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467308.1

TSSC4-208, Transcript of tumor suppressing subtransferable candidate 4, human

TSL 3

Gene TSSC4, Length 409 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSSC4-208	ENST00000467308	IL32	P24001	234 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	CHRNE	Q04844	493 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	TAB1	Q15750	504 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	ZSWIM7	Q19AV6	140 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	PGGHG	Q32M88	737 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	MISP	Q8IVT2	679 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	OR4C3	Q8NH37	302 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	RNF128	Q8TEB7	428 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	LZIC	Q8WZA0	190 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	OSTF1	Q92882	214 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	NPAS1	Q99742	590 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	S100A14	Q9HCY8	104 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	BAG5	Q9UL15	447 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308		H3BNX3	289 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	PRKD3	O94806	890 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	OPN1LW	P04000	364 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	SEMG1	P04279	462 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	RAP2A	P10114	183 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	ATP6V1C1	P21283	382 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	AQP1	P29972	269 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	PRKAR1B	P31321	381 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	CARD18	P57730	90 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	P2RY6	Q15077	328 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	ZNF141	Q15928	474 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	ABHD3	Q8WU67	409 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	KLHL15	Q96M94	604 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	TRIM2	Q9C040	744 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	AP4S1	Q9Y587	144 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	PLCE1	Q9P212	2302 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	FAM157C	P0CG43	387 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	ELK4	P28324	431 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	MAGEA2	P43356	314 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	BSPH1	Q075Z2	132 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	FAP	Q12884	760 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	NRF1	Q16656	503 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	RNF220	Q5VTB9	566 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	DTX2	Q86UW9	622 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	CMIP	Q8IY22	773 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	LILRA2	Q8N149	483 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	POC1B	Q8TC44	478 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	NEUROG1	Q92886	237 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	SLC35B4	Q969S0	331 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	YY1AP1	Q9H869	796 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	CACYBP	Q9HB71	228 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	UBQLN4	Q9NRR5	601 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	MKLN1	Q9UL63	735 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	NDUFS7	O75251	213 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	UGT2B17	O75795	530 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	ZNF682	O95780	498 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	CD8A	P01732	235 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	LINGO3	P0C6S8	592 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	ATP12A	P54707	1039 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	KCNJ10	P78508	379 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	CHRNB3	Q05901	458 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	ITGAD	Q13349	1161 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	TSC22D1	Q15714	1073 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	DUSP7	Q16829	419 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TSSC4-208	ENST00000467308	LIN52	Q52LA3	116 aa		13.91	□□□□□ -0.18

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