RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 SMURF2Q9HAU4 748 aa8.43□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 KRT84Q9NSB2 600 aa8.43□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 MED12Q93074 2177 aa8.43□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 NCKAP5O14513 1909 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 FIGNL2A6NMB9 653 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 LRRN3E7EW58 273 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 H0YC42 278 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 M0R082 166 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 CDC42EP2O14613 210 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 PRRG2O14669 202 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 PTP4A3O75365 173 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 WISP2O76076 250 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 VAMP5O95183 116 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 ALPLP05186 524 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 OSMP13725 252 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 GABRA1P14867 456 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 ABOP16442 354 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 GRPRP30550 384 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 PTGER4P35408 488 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 ESRRGP62508 458 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 HSF1Q00613 529 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 IL1RL1Q01638 556 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 GXYLT1Q4G148 440 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM225Q6GV28 225 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 SMARCD3Q6STE5 483 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 KLHL17Q6TDP4 642 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 GALNT4Q8N4A0 578 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 LRRC17Q8N6Y2 441 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 CLDN22Q8N7P3 220 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 OR52L1Q8NGH7 329 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 OR13C2Q8NGS9 318 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 OR51A7Q8NH64 312 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF417Q8TAU3 575 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 DNAJA3Q96EY1 480 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 GPA33Q99795 319 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC29A1Q99808 456 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 PRRG4Q9BZD6 226 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 CHST11Q9NPF2 352 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 RASD1Q9Y272 281 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 SIGLEC7Q9Y286 467 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 HIF3AQ9Y2N7 669 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF175Q9Y473 711 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 ATRXP46100 2492 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 SVILO95425 2214 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 TRAV27A0A087WT01 109 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 AQP7P3A6NL99 342 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 H0YJX3 145 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 H3BN98 237 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 PLPP3O14495 311 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 WDR1O75083 606 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 AKR7A3O95154 331 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 NDUFB2O95178 105 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 TPOP07202 933 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 TSPAN19P0C672 248 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 ADORA3P0DMS8 318 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 FCGR2AP12318 317 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC6A6P31641 620 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 VHLP40337 213 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 MLLT10P55197 1068 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 H3F3AP84243 136 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 PUDPQ08623 228 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 C19orf57Q0VDD7 668 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 ZP4Q12836 540 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 PON3Q15166 354 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 C3AR1Q16581 482 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 ALG10Q5BKT4 473 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF620Q6ZNG0 422 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 GALNT5Q7Z7M9 940 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM99Q8N816 258 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 OR5M9Q8NGP3 310 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM57AQ8TBR7 257 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 TEX47Q8TBZ9 253 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 FANK1Q8TC84 345 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 NRG4Q8WWG1 115 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 OXGR1Q96P68 337 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 UCN2Q96RP3 112 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 TUBA1CQ9BQE3 449 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 TEX12Q9BXU0 123 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 SRXN1Q9BYN0 137 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 OR52D1Q9H346 318 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 CALHM2Q9HA72 323 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 MCCC2Q9HCC0 563 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP4-208ENST00000462602 FANCFQ9NPI8 374 aa8.41□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.8 ms