RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436404.6

CNGA3-205, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 2,504 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-205ENST00000436404 C1orf105O95561 183 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 IL3P08700 152 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 SMIM6P0DI80 62 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 EPXP11678 715 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 KCNJ3P48549 501 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 UQCC3Q6UW78 93 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 MOB3CQ70IA8 216 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 RD3Q7Z3Z2 195 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 C6orf120Q7Z4R8 191 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 KLHDC7BQ96G42 594 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 OR1F2PQ96R84 312 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 CNIH4Q9P003 139 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 GPR31O00270 319 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 TGFB1P01137 390 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 ATP1B1P05026 303 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 KLK1P06870 262 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 UBBP0CG47 229 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 GNSP15586 552 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 RPA2P15927 270 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 CD38P28907 300 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 CAPZA2P47755 286 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 UBA52P62987 128 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 TNFRSF17Q02223 184 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 SLC3A1Q07837 685 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 ACSM3Q53FZ2 586 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 ELP2Q6IA86 826 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 FAM180BQ6P0A1 224 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 CORO6Q6QEF8 472 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 PGAP1Q75T13 922 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 NRROSQ86YC3 692 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 BCL2L14Q9BZR8 327 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 MFFQ9GZY8 342 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 SPAG17Q6Q759 2223 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 WDFY4Q6ZS81 3184 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 GABARAPH6UMI1 98 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF749O43361 778 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 REM1O75628 298 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 SPP1P10451 314 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 CNR1P21554 472 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 PAICSP22234 425 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 AK4P27144 223 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 H2BFSP57053 126 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 TCEA2Q15560 299 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 LINC00303Q3SY05 128 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 EID2Q8N6I1 236 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 OR52I2Q8NH67 350 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 FAM174AQ8TBP5 190 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 OR5P2Q8WZ92 322 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 CMTM3Q96MX0 182 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 GINS4Q9BRT9 223 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 SPHK1Q9NYA1 384 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 DMDP11532 3685 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 E9PI62 339 aa15.46■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 F5H5P2 479 aa15.46■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 SULT1C2O00338 296 aa15.46■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 GATCO43716 136 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 EML2O95834 649 aa15.46■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 EIF1P41567 113 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 IL10RAQ13651 578 aa15.46■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF542PQ5EBM4 170 aa15.46■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 UBE2NLQ5JXB2 153 aa15.46■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 OLFML2AQ68BL7 652 aa15.46■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 SERPINA12Q8IW75 414 aa15.46■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 MMP21Q8N119 569 aa15.46■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 OR5M1Q8NGP8 315 aa15.46■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 TCEAL3Q969E4 200 aa15.46■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 PIGMQ9H3S5 423 aa15.46■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 KLHL9Q9P2J3 617 aa15.46■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 DTX4Q9Y2E6 619 aa15.46■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 DAPL1A0PJW8 107 aa15.46■□□□□ 0.06
CNGA3-205ENST00000436404 UBE2QL1A1L167 161 aa15.46■□□□□ 0.06
CNGA3-205ENST00000436404 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.06
CNGA3-205ENST00000436404 MT-ND5P03915 603 aa15.46■□□□□ 0.06
CNGA3-205ENST00000436404 GP1BAP07359 652 aa15.46■□□□□ 0.06
CNGA3-205ENST00000436404 MGMTP16455 207 aa15.46■□□□□ 0.06
CNGA3-205ENST00000436404 SYPL1Q16563 259 aa15.46■□□□□ 0.06
CNGA3-205ENST00000436404 PGGHGQ32M88 737 aa15.46■□□□□ 0.06
CNGA3-205ENST00000436404 TMPRSS11BQ86T26 416 aa15.46■□□□□ 0.06
CNGA3-205ENST00000436404 CPOQ8IVL8 374 aa15.46■□□□□ 0.06
CNGA3-205ENST00000436404 CMTM4Q8IZR5 234 aa15.46■□□□□ 0.06
CNGA3-205ENST00000436404 NEIL2Q969S2 332 aa15.46■□□□□ 0.06
CNGA3-205ENST00000436404 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.06
CNGA3-205ENST00000436404 ARL5BQ96KC2 179 aa15.46■□□□□ 0.06
CNGA3-205ENST00000436404 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.06
CNGA3-205ENST00000436404 TBX5Q99593 518 aa15.46■□□□□ 0.06
CNGA3-205ENST00000436404 PTDSS2Q9BVG9 487 aa15.46■□□□□ 0.06
CNGA3-205ENST00000436404 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.06
CNGA3-205ENST00000436404 DMRT3Q9NQL9 472 aa15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60 ms