RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPCDCQ96CD2 204 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC126Q96EE4 140 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 AMDHD1Q96NU7 426 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 COL21A1Q96P44 957 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 MS4A4EQ96PG1 132 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 TUBA1CQ9BQE3 449 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF559Q9BR84 538 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANGPTL4Q9BY76 406 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 RTN4RQ9BZR6 473 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 UBQLN3Q9H347 655 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 TUBB1Q9H4B7 451 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 GLIPR2Q9H4G4 154 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM185BQ9H7F4 350 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 NRIP3Q9NQ35 241 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 TAS2R10Q9NYW0 307 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 MSRB1Q9NZV6 116 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 PEMTQ9UBM1 199 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 DCDC2Q9UHG0 476 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF639Q9UID6 485 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 PSME2Q9UL46 239 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 VDAC3Q9Y277 283 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 CFL2Q9Y281 166 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 SNX8Q9Y5X2 465 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 TLN2Q9Y4G6 2542 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 CADP27708 2225 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A1W2PPH5 198 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR6C70A6NIJ9 312 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF814B7Z6K7 855 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM157AC9JC47 383 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 C9JVG2 144 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 UPK1AO00322 258 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLOD2O00469 737 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 LSM1O15116 133 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 RGS14O43566 566 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 DIAPH2O60879 1101 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 PEX11AO75192 247 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 SNX4O95219 450 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLU7O95391 586 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 HSPA4LO95757 839 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGKV1D-16P01601 117 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 OPN1LWP04000 364 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 HPNP05981 417 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACP2P11117 423 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 NEFHP12036 1026 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 GABRA1P14867 456 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 DPP4P27487 766 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 GCKP35557 465 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPICP45877 212 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCR4P51679 360 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 CASP9P55211 416 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 C21orf58P58505 322 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 DNAJB13P59910 316 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 BIKQ13323 160 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 CEBPEQ15744 281 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 DECR1Q16698 335 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 NDUFAF6Q330K2 333 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 MTX3Q5HYI7 312 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 C6orf10Q5SRN2 563 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCNJQ5T5M9 372 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 C10orf25Q5T742 122 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 CES4AQ5XG92 561 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 HMBOX1Q6NT76 420 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 SH2D5Q6ZV89 423 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 MOB3CQ70IA8 216 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 IKBIPQ70UQ0 350 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 OLIG3Q7RTU3 272 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRSS45Q7RTY3 260 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 P4HA3Q7Z4N8 544 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 HMGN2P46Q86SG4 172 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 MARCH3Q86UD3 253 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 EXOC3L1Q86VI1 746 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 TDRPQ86YL5 185 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLCZ1Q86YW0 608 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 LACC1Q8IV20 430 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 PM20D2Q8IYS1 436 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 CLEC4FQ8N1N0 589 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 COX18Q8N8Q8 333 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 BANPQ8N9N5 519 aa3.96□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms