RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429747.5

CPNE4-201, Transcript of copine 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPNE4, Length 4,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE4-201ENST00000429747 Q6ZSR6 202 aa11.66□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 OR51D1Q8NGF3 324 aa11.66□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 KLHDC7BQ96G42 594 aa11.66□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 MARVELD1Q9BSK0 173 aa11.66□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 ULBP3Q9BZM4 244 aa11.66□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 BCL2L14Q9BZR8 327 aa11.66□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 SLC6A20Q9NP91 592 aa11.66□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 PRDM7Q9NQW5 492 aa11.66□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 A0A0J9YY10 115 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 CDC42EP2O14613 210 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 DOK2O60496 412 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 ZNF35P13682 527 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 BCL2A1Q16548 175 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 AADACL4Q5VUY2 407 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 CFAP77Q6ZQR2 320 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 CMTM4Q8IZR5 234 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 RBP7Q96R05 134 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 C20orf141Q9NUB4 165 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 CPNE7Q9UBL6 633 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 CDC14CA4D256 554 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 E9PI62 339 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 H0Y8X5 98 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 PRH1P02810 166 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 DCNP07585 359 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 ITGA5P08648 1049 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 RPS27P42677 84 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 LSSP48449 732 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 GPR18Q14330 331 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 PRSS53Q2L4Q9 553 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 ZBTB37Q5TC79 503 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 CD163Q86VB7 1156 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 FAM46BQ96A09 425 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 HAVCR1Q96D42 359 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 ABHD1Q96SE0 405 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 MRI1Q9BV20 369 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 ELOVL3Q9HB03 270 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 FBXL4Q9UKA2 621 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 POM121BA6NF01 834 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 OR5K4A6NMS3 321 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 C17orf105B2RV13 164 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 SLC16A7O60669 478 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 DUSP8Q13202 625 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 Q499Y3 187 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 LYPD8Q6UX82 237 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 ZNF546Q86UE3 836 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 GPAT4Q86UL3 456 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 OR1E3Q8WZA6 343 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 TSSK2Q96PF2 358 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 DUSP22Q9NRW4 184 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE4-201ENST00000429747 GPR171O14626 319 aa11.64□□□□□ -0.55
CPNE4-201ENST00000429747 PNMTP11086 282 aa11.64□□□□□ -0.55
CPNE4-201ENST00000429747 UBL4AP11441 157 aa11.64□□□□□ -0.55
CPNE4-201ENST00000429747 TSFMP43897 325 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CPNE4-201ENST00000429747 BDH1Q02338 343 aa11.64□□□□□ -0.55
CPNE4-201ENST00000429747 SPOCK1Q08629 439 aa11.64□□□□□ -0.55
CPNE4-201ENST00000429747 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CPNE4-201ENST00000429747 CD300LDQ6UXZ3 194 aa11.64□□□□□ -0.55
CPNE4-201ENST00000429747 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CPNE4-201ENST00000429747 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CPNE4-201ENST00000429747 NAXEQ8NCW5 288 aa11.64□□□□□ -0.55
CPNE4-201ENST00000429747 MORN4Q8NDC4 146 aa11.64□□□□□ -0.55
CPNE4-201ENST00000429747 CCL4L1Q8NHW4 92 aa11.64□□□□□ -0.55
CPNE4-201ENST00000429747 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CPNE4-201ENST00000429747 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa11.64□□□□□ -0.55
CPNE4-201ENST00000429747 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa11.64□□□□□ -0.55
CPNE4-201ENST00000429747 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa11.64□□□□□ -0.55
CPNE4-201ENST00000429747 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CPNE4-201ENST00000429747 SCGB1D2O95969 90 aa11.64□□□□□ -0.55
CPNE4-201ENST00000429747 THBS1P07996 1170 aa11.64□□□□□ -0.55
CPNE4-201ENST00000429747 ZNF806P0C7X5 589 aa11.64□□□□□ -0.55
CPNE4-201ENST00000429747 RAD52P43351 418 aa11.64□□□□□ -0.55
CPNE4-201ENST00000429747 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CPNE4-201ENST00000429747 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CPNE4-201ENST00000429747 C17orf47Q8NEP4 570 aa11.64□□□□□ -0.55
CPNE4-201ENST00000429747 TMEM185AQ8NFB2 350 aa11.64□□□□□ -0.55
CPNE4-201ENST00000429747 CHAC2Q8WUX2 184 aa11.64□□□□□ -0.55
CPNE4-201ENST00000429747 PATE1Q8WXA2 126 aa11.64□□□□□ -0.55
CPNE4-201ENST00000429747 MNTQ99583 582 aa11.64□□□□□ -0.55
CPNE4-201ENST00000429747 ARHGDIGQ99819 225 aa11.64□□□□□ -0.55
CPNE4-201ENST00000429747 RNF32Q9H0A6 362 aa11.64□□□□□ -0.55
CPNE4-201ENST00000429747 EVA1BQ9NVM1 165 aa11.64□□□□□ -0.55
CPNE4-201ENST00000429747 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CPNE4-201ENST00000429747 SIP14410 1827 aa11.64□□□□□ -0.55
CPNE4-201ENST00000429747 CIB4A0PJX0 185 aa11.64□□□□□ -0.55
CPNE4-201ENST00000429747 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms