RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 AKR1C1Q04828 323 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 OR5M10Q6IEU7 315 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF836Q6ZNA1 936 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 FUNDC1Q8IVP5 155 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 OR14L1PQ8NHC6 308 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 SLC38A5Q8WUX1 472 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 TBC1D20Q96BZ9 403 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 UBXN10Q96LJ8 280 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 SLC25A31Q9H0C2 315 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 CCL26Q9Y258 94 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 URB1O60287 2271 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 DUX1O43812 170 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 MAOBP27338 520 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 C3orf38Q5JPI3 329 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 Q6ZSR9 355 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 SSX9Q7RTT3 188 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 OR52I1Q8NGK6 324 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 TEX37Q96LM6 180 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 PBX4Q9BYU1 374 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 CPNE7Q9UBL6 633 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 FTSJ1Q9UET6 329 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF337Q9Y3M9 751 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 TGFBR1P36897 503 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 SERPINF1P36955 418 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 OR52W1Q6IF63 320 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 RTL10Q7L3V2 364 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 SLC30A7Q8NEW0 376 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 AP1G1O43747 822 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 COX20Q5RI15 118 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 NIPAL3Q6P499 406 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 LIX1LQ8IVB5 337 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 SORCS2Q96PQ0 1159 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 MYADMQ96S97 322 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 ADOQ96SZ5 270 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 EMC7Q9NPA0 242 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 NIT2Q9NQR4 276 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 MYO7AQ13402 2215 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 A6NIZ1 184 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 H3BUI4 141 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 MPPED1O15442 326 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 KCNK5O95279 499 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 MAKP20794 623 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 RAP1BP61224 184 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 ERVK-16P61578 105 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 RAP1AP62834 184 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 BDH1Q02338 343 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 TMEM200AQ86VY9 491 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 OR52H1Q8NGJ2 320 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 ASB11Q8WXH4 323 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 NUDT22Q9BRQ3 303 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 ALX3O95076 343 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 UBL3O95164 117 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 OLIG3Q7RTU3 272 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 MZB1Q8WU39 189 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 NOX4Q9NPH5 578 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 NRIP3Q9NQ35 241 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 CDC14CA4D256 554 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 SULT1B1O43704 296 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 ADRA1AP35348 466 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF765Q7L2R6 523 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 ZFAND1Q8TCF1 268 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
PTPRU-204ENST00000428026 APBB3O95704 486 aa13.46□□□□□ -0.26
PTPRU-204ENST00000428026 SIRPAP78324 504 aa13.46□□□□□ -0.26
PTPRU-204ENST00000428026 DUSP6Q16828 381 aa13.46□□□□□ -0.26
PTPRU-204ENST00000428026 PAQR9Q6ZVX9 377 aa13.46□□□□□ -0.26
PTPRU-204ENST00000428026 GAREM2Q75VX8 874 aa13.46□□□□□ -0.26
PTPRU-204ENST00000428026 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa13.46□□□□□ -0.26
PTPRU-204ENST00000428026 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.26
PTPRU-204ENST00000428026 IL22RA1Q8N6P7 574 aa13.46□□□□□ -0.26
PTPRU-204ENST00000428026 OR52E1Q8NGJ3 308 aa13.46□□□□□ -0.26
PTPRU-204ENST00000428026 SLC22A12Q96S37 553 aa13.46□□□□□ -0.26
PTPRU-204ENST00000428026 DDOQ99489 341 aa13.46□□□□□ -0.26
PTPRU-204ENST00000428026 PRR14Q9BWN1 585 aa13.46□□□□□ -0.26
PTPRU-204ENST00000428026 SCO1O75880 301 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRU-204ENST00000428026 CD79AP11912 226 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRU-204ENST00000428026 OXA1LQ15070 435 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRU-204ENST00000428026 SFRP5Q5T4F7 317 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRU-204ENST00000428026 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRU-204ENST00000428026 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
PTPRU-204ENST00000428026 KIF25Q9UIL4 384 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRU-204ENST00000428026 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRU-204ENST00000428026 H3BNC9 293 aa13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms