RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409093.1

LRRTM4-202, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene LRRTM4, Length 2,247 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-202ENST00000409093 ARGFXA6NJG6 315 aa9.15□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 IDSB3KWA1 339 aa9.15□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 D6RAR5 112 aa9.15□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 M0R3G1 203 aa9.15□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 MYL12BO14950 172 aa9.15□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 AIREO43918 545 aa9.15□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 HCN1O60741 890 aa9.15□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 RAB36O95755 333 aa9.15□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 NGFRP08138 427 aa9.15□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 RAB3AP20336 220 aa9.15□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 TBXA2RP21731 343 aa9.15□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 ADH7P40394 386 aa9.15□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 MTNR1AP48039 350 aa9.15□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 STARP49675 285 aa9.15□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 GPR143P51810 404 aa9.15□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 CDH11P55287 796 aa9.15□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 FXYD6P3P58550 94 aa9.15□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 PLCXD2Q0VAA5 305 aa9.15□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 TMEM44Q2T9K0 475 aa9.15□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 FNDC7Q5VTL7 733 aa9.15□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 PYHIN1Q6K0P9 492 aa9.15□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 SMARCD3Q6STE5 483 aa9.15□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 CLEC2AQ6UVW9 174 aa9.15□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 SPATC1Q76KD6 591 aa9.15□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa9.15□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM71CQ8NEG0 241 aa9.15□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 OR52I1Q8NGK6 324 aa9.15□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 RFKQ969G6 155 aa9.15□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 LGALS12Q96DT0 336 aa9.15□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 RNFT2Q96EX2 444 aa9.15□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 POM121Q96HA1 1249 aa9.15□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 MGLLQ99685 303 aa9.15□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 IFT27Q9BW83 186 aa9.15□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 MND1Q9BWT6 205 aa9.15□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 APMAPQ9HDC9 416 aa9.15□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 OCIAD1Q9NX40 245 aa9.15□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 CLEC2DQ9UHP7 191 aa9.15□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 SIGLEC7Q9Y286 467 aa9.15□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 WDFY4Q6ZS81 3184 aa9.14□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 IRGMA1A4Y4 181 aa9.14□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 OR6C76A6NM76 312 aa9.14□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF264O43296 627 aa9.14□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 ICOSLGO75144 302 aa9.14□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 CSO75390 466 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 APOL3O95236 402 aa9.14□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 SLC2A10O95528 541 aa9.14□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 GADD45AP24522 165 aa9.14□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 UGT2B10P36537 528 aa9.14□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 RGS6P49758 472 aa9.14□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 P2RY4P51582 365 aa9.14□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 RAB40BQ12829 278 aa9.14□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 SKP2Q13309 424 aa9.14□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 COTL1Q14019 142 aa9.14□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 OAFQ86UD1 273 aa9.14□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 KLHL36Q8N4N3 616 aa9.14□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 OR51A7Q8NH64 312 aa9.14□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 PTP4A1Q93096 173 aa9.14□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 OTULINQ96BN8 352 aa9.14□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa9.14□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 RNF170Q96K19 258 aa9.14□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa9.14□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa9.14□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa9.14□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 BHLHE40O14503 412 aa9.13□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 OIP5O43482 229 aa9.13□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 DLGAP3O95886 979 aa9.13□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 MYL12AP19105 171 aa9.13□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 CAPZA1P52907 286 aa9.13□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 C1DQ13901 141 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 PPA1Q15181 289 aa9.13□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 TSTQ16762 297 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 AGAP6Q5VW22 663 aa9.13□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 NXNL2Q5VZ03 156 aa9.13□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 DESI1Q6ICB0 168 aa9.13□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 CBLN3Q6UW01 205 aa9.13□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 APOOLQ6UXV4 268 aa9.13□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 LINC00114Q6XXX2 140 aa9.13□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 THSD4Q6ZMP0 1018 aa9.13□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 ANKRD37Q7Z713 158 aa9.13□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 SLC37A3Q8NCC5 494 aa9.13□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 METTL21AQ8WXB1 218 aa9.13□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 UFD1Q92890 307 aa9.13□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 C3orf49Q96BT1 292 aa9.13□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 AGAP4Q96P64 663 aa9.13□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 ENKD1Q9H0I2 346 aa9.13□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 SLC6A15Q9H2J7 730 aa9.13□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 A0A087WUJ7 227 aa9.13□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa9.13□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa9.13□□□□□ -0.95
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM86C2PA6NEL3 165 aa9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms