RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356384.4

RXRA-201, Transcript of retinoid X receptor alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RXRA, Length 5,770 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRA-201ENST00000356384 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 GABRB3P28472 473 aa14.95□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 SLC30A7Q8NEW0 376 aa14.95□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 OR11L1Q8NGX0 322 aa14.95□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 WWTR1Q9GZV5 400 aa14.95□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 CLMPQ9H6B4 373 aa14.95□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 NOX4Q9NPH5 578 aa14.95□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP14.95□□□□□ -0.021e-6■■■■□ 25.9
RXRA-201ENST00000356384 MYOTQ9UBF9 498 aa14.95□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 NAA40Q86UY6 237 aa14.95□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 NLRP8Q86W28 1048 aa14.95□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 RAB3CQ96E17 227 aa14.95□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 TMEM59Q9BXS4 323 aa14.95□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 SLC39A9Q9NUM3 307 aa14.95□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 SUSD5O60279 629 aa14.95□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 PRPH2P23942 346 aa14.95□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 FCRL1Q96LA6 429 aa14.95□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 ADAM19Q9H013 955 aa14.95□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 LRIT1Q9P2V4 623 aa14.95□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 SPEF2Q9C093 1822 aa14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 RFXAPO00287 272 aa14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 KCNK2O95069 426 aa14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 C1orf105O95561 183 aa14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 SLC10A3P09131 477 aa14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 DPP4P27487 766 aa14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 ACSM1Q08AH1 577 aa14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 ILKQ13418 452 aa14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 ACTBL2Q562R1 376 aa14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 ZNF480Q8WV37 535 aa14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 A8MVM7 634 aa14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 I6L893 689 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 M0QZQ0 153 aa14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 GPR75O95800 540 aa14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 T-ENOLP0DO92 83 aa14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 INHBCP55103 352 aa14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 CTBSQ01459 385 aa14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 LTB4RQ15722 352 aa14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 OPN5Q6U736 354 aa14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 PPP1R3BQ86XI6 285 aa14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 SKA3Q8IX90 412 aa14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 METTL4Q8N3J2 472 aa14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 ZNF566Q969W8 418 aa14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 SLC41A2Q96JW4 573 aa14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 NXPH3O95157 252 aa14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 DHRS4L1P0CG22 281 aa14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 TLE4Q04727 773 aa14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 CLLU1OSQ5K130 101 aa14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 NPSR1Q6W5P4 371 aa14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 FAM109AQ8N4B1 249 aa14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 TCTN2Q96GX1 697 aa14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 PISDQ9UG56 409 aa14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 LAMB4A4D0S4 1761 aa14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 TMEM72A0PK05 275 aa14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 STMND1H3BQB6 276 aa14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 H7C1Q1 480 aa14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 WNT7BP56706 349 aa14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 SLC5A12Q1EHB4 618 aa14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 BAGE3Q86Y29 109 aa14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 BAGE2Q86Y30 109 aa14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 STT3BQ8TCJ2 826 aa14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 ARPC5LQ9BPX5 153 aa14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 CDK4P11802 303 aa14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 HBA1P69905 142 aa14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 CLINT1Q14677 625 aa14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 TESK1Q15569 626 aa14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 OR1E3Q8WZA6 343 aa14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 KATNB1Q9BVA0 655 aa14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 GON7Q9BXV9 100 aa14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 SELENOIQ9C0D9 397 aa14.94□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa14.93□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 CD46P15529 392 aa14.93□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 RPS25P62851 125 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 RBPJQ06330 500 aa14.93□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 FXNQ16595 210 aa14.93□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 B3GLCTQ6Y288 498 aa14.93□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 TMEFF1Q8IYR6 380 aa14.93□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 RLN3Q8WXF3 142 aa14.93□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 C1orf198Q9H425 327 aa14.93□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 BLACEA4D250 179 aa14.93□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 HTR2CP28335 458 aa14.93□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 GDNFP39905 211 aa14.93□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 OPRD1P41143 372 aa14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms