RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338546.9

HPS1-202, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS1, Length 1,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-202ENST00000338546 SOX3P41225 446 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 CASP3P42574 277 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 CRYBB2P43320 205 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 RPS5P46782 204 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 DIO1P49895 249 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 CTXN1P60606 82 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 ERVK-25P63136 954 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 DOC2BQ14184 412 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 OR10G3Q8NGC4 313 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 OR5J2Q8NH18 312 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 S100ZQ8WXG8 99 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 GATAD2BQ8WXI9 593 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 SNX18Q96RF0 628 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 PTDSS2Q9BVG9 487 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 GPR87Q9BY21 358 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 ADGRL4Q9HBW9 690 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 CORINQ9Y5Q5 1042 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 DAPL1A0PJW8 107 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 C4orf47A7E2U8 309 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 PRR33A8MZF0 331 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 C21orf140B9A014 251 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 GPX5O75715 221 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 DXOO77932 396 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 APOL3O95236 402 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 HPP00738 406 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 CD53P19397 219 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 GABRA5P31644 462 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 RPS15P62841 145 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 CHAF1BQ13112 559 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 OR2G6Q5TZ20 316 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 FCRLBQ6BAA4 426 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 SHFQ7M4L6 423 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 IGFN1Q86VF2 1251 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 JAZF1Q86VZ6 243 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 CYB561A3Q8NBI2 242 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 SDR9C7Q8NEX9 313 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 CT55Q8WUE5 264 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 TM9SF4Q92544 642 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 CENPOQ9BU64 300 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 POTEKPQ9BYX7 375 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 C17orf51A8MQB3 221 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 C9orf172C9J069 976 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 SLC30A4O14863 429 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 FZD7O75084 574 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 OR2T7P0C7T2 308 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 ADH6P28332 368 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 SSR4P51571 173 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 SLC16A1P53985 500 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 MLF1P58340 268 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 TAS2R43P59537 309 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 SPEM2Q0P670 501 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 LIPKQ5VXJ0 399 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 PIP4P1Q86T03 277 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 SCAIQ8N9R8 606 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 OR2T27Q8NH04 317 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 MFSD8Q8NHS3 518 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 SMPDL3BQ92485 455 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 BORCS5Q969J3 196 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 NTNG2Q96CW9 530 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 DDIT4LQ96D03 193 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 ALG8Q9BVK2 526 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 GALNT9Q9HCQ5 603 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 PALMDQ9NP74 551 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 KLHL1Q9NR64 748 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 ASB6Q9NWX5 421 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 TOR4AQ9NXH8 423 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 BABAM2Q9NXR7 383 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 MED11Q9P086 117 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 GRHPRQ9UBQ7 328 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 A0A087WZY1 265 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 GMFGO60234 142 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 GLCEO94923 617 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 MT-ND5P03915 603 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 SPI1P17947 270 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 SOX6P35712 828 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 EIF1P41567 113 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 HSF2Q03933 536 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 ZP4Q12836 540 aa14.71□□□□□ -0.05
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