RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328796.4

CLDN6-201, Transcript of claudin 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN6, Length 1,369 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN6-201ENST00000328796 C12orf49Q9H741 205 aa14.96□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 ELOVL5Q9NYP7 299 aa14.96□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 ABCA4P78363 2273 aa14.96□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 CYSRT1A8MQ03 144 aa14.95□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 VAMP5O95183 116 aa14.95□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 PTNP21246 168 aa14.95□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 OR3A2P47893 321 aa14.95□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 LTBQ06643 244 aa14.95□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 NKAIN4Q8IVV8 208 aa14.95□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 FAM86B1Q8N7N1 296 aa14.95□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa14.95□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 C7orf34Q96L11 122 aa14.95□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 NSMCE2Q96MF7 247 aa14.95□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 RASD1Q9Y272 281 aa14.95□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa14.95□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 M0R082 166 aa14.94□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 FFAR1O14842 300 aa14.94□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 PRSS23O95084 383 aa14.94□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 GRPRP30550 384 aa14.94□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 NTF4P34130 210 aa14.94□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 RBM34P42696 430 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 FAM27E3Q08E93 113 aa14.94□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 ST3GAL3Q11203 375 aa14.94□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 BEND4Q6ZU67 534 aa14.94□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 STK32CQ86UX6 486 aa14.94□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 OFCC1Q8IZS5 231 aa14.94□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 ZIC4Q8N9L1 334 aa14.94□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 OR9K2Q8NGE7 335 aa14.94□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 ZNF417Q8TAU3 575 aa14.94□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 MOGAT1Q96PD6 335 aa14.94□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 MUC13Q9H3R2 512 aa14.94□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 SLC24A3Q9HC58 644 aa14.94□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 ACTR3BQ9P1U1 418 aa14.94□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 SEC14L4Q9UDX3 406 aa14.94□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa14.94□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 CORINQ9Y5Q5 1042 aa14.94□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 ENPP4Q9Y6X5 453 aa14.94□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 PRR14LQ5THK1 2151 aa14.94□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 APCP25054 2843 aa14.94□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 J3KTA2 159 aa14.93□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 MT-ATP6P00846 226 aa14.93□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 SEMG1P04279 462 aa14.93□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 POU2F1P14859 743 aa14.93□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 EDNRAP25101 427 aa14.93□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 CCKARP32238 428 aa14.93□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 IFNA8P32881 189 aa14.93□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 YAP1P46937 504 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 BNIP1Q12981 228 aa14.93□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 POU4F3Q15319 338 aa14.93□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 TMEM225Q6GV28 225 aa14.93□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 GABRG1Q8N1C3 465 aa14.93□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 SCAIQ8N9R8 606 aa14.93□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 MARVELD3Q96A59 401 aa14.93□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 TMEM45BQ96B21 275 aa14.93□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 PYURFQ96I23 114 aa14.93□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 HS6ST2Q96MM7 605 aa14.93□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa14.93□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa14.92□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 LRRN3E7EW58 273 aa14.92□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 PDE5AO76074 875 aa14.92□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 IGF2P01344 180 aa14.92□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 ATP6V1B2P21281 511 aa14.92□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 FUT4P22083 530 aa14.92□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 UGT2B15P54855 530 aa14.92□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 VLDLRP98155 873 aa14.92□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 ZNF74Q16587 644 aa14.92□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa14.92□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 IQCCQ4KMZ1 466 aa14.92□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 DNAL1Q4LDG9 190 aa14.92□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 MTX3Q5HYI7 312 aa14.92□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 LCN8Q6JVE9 175 aa14.92□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 STAC2Q6ZMT1 411 aa14.92□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 GPAT4Q86UL3 456 aa14.92□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa14.92□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 TMEM255BQ8WV15 326 aa14.92□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 TMEM239Q8WW34 195 aa14.92□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 OXGR1Q96P68 337 aa14.92□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 FNDC11Q9BVV2 318 aa14.92□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 ASPNQ9BXN1 380 aa14.92□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 FANCFQ9NPI8 374 aa14.92□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 NDUFAF4Q9P032 175 aa14.92□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 B3GAT1Q9P2W7 334 aa14.92□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 KCNN3Q9UGI6 736 aa14.92□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 TACC2O95359 2948 aa14.91□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 GYG2O15488 501 aa14.91□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CLDN6-201ENST00000328796 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms