RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324545.8

USP9X-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 9 X-linked, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP9X, Length 12,401 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9X-201ENST00000324545 IRS1P35568 1242 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 GK3PQ14409 553 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 EPGNQ6UW88 154 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 THNSL2Q86YJ6 484 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 OR4N2Q8NGD1 307 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 OR51D1Q8NGF3 324 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 OR13C9Q8NGT0 318 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 ABHD4Q8TB40 342 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 SLC39A13Q96H72 371 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 OR6C1Q96RD1 312 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 ASIC5Q9NY37 505 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 PIGLQ9Y2B2 252 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 CREBBPQ92793 2442 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 PTPRMP28827 1452 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 NUDT1P36639 197 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 SRP14P37108 136 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 GTDC1Q4AE62 458 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 BLNKQ8WV28 456 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 MISP3Q96FF7 219 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 APIPQ96GX9 242 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 BTF3L4Q96K17 158 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 WDR76Q9H967 626 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 SIAEQ9HAT2 523 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 RGPD1P0DJD0 1748 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 SLC16A7O60669 478 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 GOSR1O95249 250 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 SEMA4FO95754 770 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 TRAPPC2P0DI81 140 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 TRAPPC2BP0DI82 140 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP7□□□□□ -1.297e-8■■■□□ 18.4
USP9X-201ENST00000324545 GPR143P51810 404 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 ZNF805Q5CZA5 627 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 SPRYD7Q5W111 196 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 STACQ99469 402 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 ACOXLQ9NUZ1 547 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 ANKMY1Q9P2S6 941 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 AMTP48728 403 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 RAC1P63000 192 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 TMEM41BQ5BJD5 291 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 PODNL1Q6PEZ8 512 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 TMIEQ8NEW7 156 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 TRMOQ9BU70 441 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 FUNDC2Q9BWH2 189 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 KCNMB3Q9NPA1 279 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 EMC9Q9Y3B6 208 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 D6RAR5 112 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 GPR171O14626 319 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 ADAM12O43184 909 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 GCSHP23434 173 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 HOXA9P31269 272 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 NANOGP8Q6NSW7 305 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 TMEM208Q9BTX3 173 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 NANOGQ9H9S0 305 aa7□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 EMC8O43402 210 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 ALOX12BO75342 701 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 OR8G3PP0DMU2 310 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 SLC25A6P12236 298 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 NADSYN1Q6IA69 706 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 NETO1Q8TDF5 533 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 GPR78Q96P69 363 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 DOK5Q9P104 306 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 NCKAP5O14513 1909 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 A0A1W2PR80 420 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 KCNE1P15382 129 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 USF1P22415 310 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 ACRV1P26436 265 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 RAB5CP51148 216 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 GALEQ14376 348 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 NR4A3Q92570 626 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 PIRO00625 290 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 GNG10P50151 68 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.292e-6■■■■□ 23.6
USP9X-201ENST00000324545 OR10AD1Q8NGE0 317 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 SNAPC3Q92966 411 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 RNF170Q96K19 258 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 NECTIN4Q96NY8 510 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 TMEM140Q9NV12 185 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 INSL5Q9Y5Q6 135 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 TGM5O43548 720 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 SNAPINO95295 136 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 PRMT2P55345 433 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 GBX1Q14549 363 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 HRASLS5Q96KN8 279 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 SMIM17P0DL12 118 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 H3F3AP84243 136 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 OR11L1Q8NGX0 322 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 FEVQ99581 238 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.5 ms