RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299259.10

COPS2-201, Transcript of COP9 signalosome subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene COPS2, Length 2,036 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS2-201ENST00000299259 OR2M3Q8NG83 312 aa9.51□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 OR4K17Q8NGC6 315 aa9.51□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa9.51□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 PTP4A1Q93096 173 aa9.51□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 DNAJA3Q96EY1 480 aa9.51□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 MRGPRX4Q96LA9 322 aa9.51□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 LRFN3Q9BTN0 628 aa9.51□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 JAM3Q9BX67 310 aa9.51□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 FAM117AQ9C073 453 aa9.51□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 B3GNT4Q9C0J1 378 aa9.51□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 OR11A1Q9GZK7 315 aa9.51□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 HPF1Q9NWY4 346 aa9.51□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa9.51□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa9.51□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 BCL10O95999 233 aa9.51□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 SCG5P05408 212 aa9.51□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 SERPINA7P05543 415 aa9.51□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 GYPBP06028 91 aa9.51□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 LIMS3P0CW19 117 aa9.51□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 LIMS4P0CW20 117 aa9.51□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 CCL3P10147 92 aa9.51□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 CLUP10909 449 aa9.51□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 F8A1P23610 371 aa9.51□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 SDHAP31040 664 aa9.51□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 CLK1P49759 484 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 CTXN1P60606 82 aa9.51□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 LSM3P62310 102 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 GABREP78334 506 aa9.51□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 Q0VFX4 171 aa9.51□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 SGCBQ16585 318 aa9.51□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 FAM122BQ7Z309 247 aa9.51□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 JAZF1Q86VZ6 243 aa9.51□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 FADS6Q8N9I5 356 aa9.51□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 NDNFQ8TB73 568 aa9.51□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 SLC25A36Q96CQ1 311 aa9.51□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 FRMD6Q96NE9 622 aa9.51□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 NPAS1Q99742 590 aa9.51□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 ZNF208O43345 1280 aa9.5□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 OR2T1O43869 369 aa9.5□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 F13BP05160 661 aa9.5□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 VBP1P61758 197 aa9.5□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 NCS1P62166 190 aa9.5□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 POU4F2Q12837 409 aa9.5□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 ATP1A4Q13733 1029 aa9.5□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 SSX1Q16384 188 aa9.5□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa9.5□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 SLC25A53Q5H9E4 307 aa9.5□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 OR2G6Q5TZ20 316 aa9.5□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 LCN1P1Q5VSP4 162 aa9.5□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 B3GLCTQ6Y288 498 aa9.5□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 WDSUB1Q8N9V3 476 aa9.5□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 OR5J2Q8NH18 312 aa9.5□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 OR6S1Q8NH40 331 aa9.5□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 PAQR8Q8TEZ7 354 aa9.5□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 DDIT4LQ96D03 193 aa9.5□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa9.5□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 Q96M85 177 aa9.5□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 NMNAT3Q96T66 252 aa9.5□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 ASPNQ9BXN1 380 aa9.5□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa9.5□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 PTGES2Q9H7Z7 377 aa9.5□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 ERVK13-1Q9NX77 482 aa9.5□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 FBXL2Q9UKC9 423 aa9.5□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa9.49□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 C12orf71A8MTZ7 269 aa9.49□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 J3QRE1 110 aa9.49□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 IMPA2O14732 288 aa9.49□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 TXNDC12O95881 172 aa9.49□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 GRPRP30550 384 aa9.49□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 MAP2K6P52564 334 aa9.49□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 LGALS3BPQ08380 585 aa9.49□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 SLC6A19Q695T7 634 aa9.49□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 GPR139Q6DWJ6 353 aa9.49□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 LEG1Q6P5S2 330 aa9.49□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 LHFPL3Q86UP9 236 aa9.49□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 ATCAYQ86WG3 371 aa9.49□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 TMPRSS12Q86WS5 348 aa9.49□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 KLHL36Q8N4N3 616 aa9.49□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 ACBD7Q8N6N7 88 aa9.49□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 NPEPL1Q8NDH3 523 aa9.49□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 OR52N1Q8NH53 320 aa9.49□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 ZPLD1Q8TCW7 415 aa9.49□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 TSPAN32Q96QS1 320 aa9.49□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 TEAD3Q99594 435 aa9.49□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 ANGPTL4Q9BY76 406 aa9.49□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 ADGRL4Q9HBW9 690 aa9.49□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 SH2D2AQ9NP31 389 aa9.49□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 NDUFB11Q9NX14 153 aa9.49□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 HAO2Q9NYQ3 351 aa9.49□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 GRHPRQ9UBQ7 328 aa9.49□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 SEC14L4Q9UDX3 406 aa9.49□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
COPS2-201ENST00000299259 NCKAP5O14513 1909 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms